单细胞RNA-seq分析介绍 / 开普饭

编译:怀瑾,编辑:夏甘草.江舜尧. 原创微文,欢迎转发转载. 导读转录组分析是研究肝功能,肝病过程中基因表达变化,鉴定预后标志或特征以及发现新治疗靶标的重要方法.单细胞RNA测序(scRNA-seq ...

编译:不二,编辑:十九.江舜尧. 原创微文,欢迎转发转载. 导读背景:人体细胞图谱是一项大型的国际合作项目,旨在绘制人体所有细胞类型.单细胞RNA测序可以生成高质量的数据,绘制此类图谱.但是,新鲜样 ...

编译:罗睺,编辑:十九.江舜尧. 原创微文,欢迎转发转载. 导读单细胞RNA测序(scRNA-seq)是研究脑和中枢神经系统(CNS)中单个细胞转录组的一种有前途的方法.这项技术充当了神经科学,计算 ...

中国科学院动物研究所及中国科学院北京基因研究所的专家们,揭开了皮肤衰老过程中细胞类型特异性转录网络的变化,并首次绘制出了人类皮肤衰老的单细胞转录组图谱. 衰老,是人类的自然进程. 随着年龄增长,人体的 ...

编译:杨峰,编辑:夏甘草.江舜尧. 原创微文,欢迎转发转载. 导读心肌肥厚有时会作为对压力超负荷.容积超负荷或梗死后重塑引起的左心室(LV)壁应力增加的代偿反应出现.然而,在长期的疾病应激诱导的心肌 ...

编译:小北,编辑:夏甘草.江舜尧. 原创微文,欢迎转发转载. 导读在哺乳动物胚胎形成过程中,差异基因逐步构建起每个组织和器官系统的命运和复杂性.在本文中研究者系统的定量了10.5天胚胎的发育到出生小 ...

编译:微科盟刘娟,编辑:微科盟景行.江舜尧. 原创微文,欢迎转发转载. 导读生物学和药理学研究的基础是揭示空间尺度的细胞异质性.组织功能和结构.与传统单分子或大数据组学方法不同,尖端的空间转录组学技 ...

生信实操随着测序技术的进步开发了一种单细胞转录组测序(scRNA-seq)技术,单细胞转录组测序技术可以一次检测成千上万个细胞的转录水平,在单细胞水平上检测和定量基因表达水平变化,从而揭示bulk ...

Single-cell RNA-seq enables comprehensive tumour and immune cell profiling in primary breast cancer利 ...

编译:小北,编辑:十九.江舜尧. 原创微文,欢迎转发转载. 导读目的:肿瘤的异质性是胃腺癌(GA)准确诊断和治疗的主要障碍.研究者在GA中利用单细胞RNA测序报道了系统的转录图谱来解释分子和细胞内的 ...

编译:小北,编辑:十九.江舜尧. 原创微文,欢迎转发转载. 导读背景:心肌炎能够发展成为扩张型心肌病(DCM),这就需要心脏植入(HTx).心肌炎阶段的免疫学网络尚不明确.本研究旨在探究在心肌炎向D ...

编译:有点卡,编辑:十九.江舜尧. 原创微文,欢迎转发转载. 导读目前全世界癌症的发病率持续增加,约40%的癌症患者接受化疗,一种常见的副作用也伴随而生-胃肠道粘膜炎,通常表现为小肠绒毛缩短,粘膜上 ...

编译:刘宁,编辑:十九.江舜尧. 原创微文,欢迎转发转载. 韩国首尔国立大学In Ah Kim等人于2019年11月22日在医学国际权威期刊Radiotherapy and Oncology在线发表题 ...

RNA测序相信大家已经接触到不少了,它的样品通常来自研究某一组织细胞群.这些细胞被认为是同质的,也就是说每一个细胞内的表达水平被认为是相似的.但事实上细胞之间的异质性的很普遍的,RNA测序最终将表达量 ...

当你的才华还撑不起你的野心时,请潜下心来,脚踏实地,跟着我们慢慢进步.不知不觉在单细胞转录组领域做知识分析也快两年了,通过文献速递这个栏目很幸运聚集了一些小伙伴携手共进,一起成长. 文献速递栏目通过简 ...

并把小熊猫[设为星标] 这次美股除了后面要来的燃石医学,这个还没招股,估计是和京东一起来. <燃石医学(代码:BNR)美股新股打新分析介绍以及认购建议> 还有个医药股传奇生物,这个也是不错 ...

这部分开始进行基本的富集分析,两类 A:差异基因富集分析(不需要表达值,只需要gene name) B: 基因集(gene set)富集分析(不管有无差异,需要全部genes表达值) ######## ...

编译:不二,编辑:景行.江舜尧. 原创微文,欢迎转发转载. 导读为了预测人类冠状病毒的生物取向性,研究人员利用单细胞转录组学分析了28种SARS-CoV-2和冠状病毒相关受体因子(SCARF).SC ...

单细胞RNA-seq分析介绍