RNA-seq的fastq文件里面为什么有gc含量的双峰 / 开普饭

导语今天和大家分享的是2020年1月份发表在SCIENTIFIC DATA杂志上的一篇文章(IF=5.929)"Single-cell RNA sequencing of human ki ...

RNA测序(RNA-seq)在过往十年里逐渐成为全转录组水平分析差异基因表达和研究mRNA差异剪接必不可少的工具.RNA-seq帮助大家对RNA生物学的理解会越来越全面:从转录本在何时何地转录到RNA ...

SRA文件的解压主要是用sratools中的fastq,但是这个软件不能多线程运行,随着测序数据越来越大,fastq的解压速度可能成为整个流程的瓶颈(其实并不会:P,不过没有多线程就是不爽). 不过s ...

前面我们发布了明码标价之普通转录组上游分析,终于开始接单了,第一个项目介绍98个转录组测序数据的表达量获取,超级简单,就是耗费计算资源,500G的fastq数据文件,中间步骤加起来,起码耗费2个T的 ...

写在前面我隐约记得我写过类似主题,但也并不确定.相关功能,我并不写使用说明的冲动,一者是这些功能至少是四五年前就有的,二者是这些功能其实比较简单,但也并不常用.然而,现在我还是决定写一篇.主要动机简 ...

m6A(N6-methyladenosine,6-甲基腺苷)是真核生物中最常见最丰富的RNA修饰,作为一种可逆修饰,RNA既可以在甲基化转移酶METTL3/14 等酶的作用下发生m6A甲基化修饰,又可 ...

RNA免疫共沉淀(RNA Immunoprecipitation,RIP )是研究细胞内RNA与蛋白结合情况的技术,是了解转录后调控网络动态过程的有力工具,能帮助我们发现miRNA的调节靶点. RIP ...

我们的电脑在使用一段时间后,C盘就会产生一些垃圾文件,然后就会影响我们的系统运行速度,但是如果你手头没有合适的优化工具,那我们也可以找到这些文件去手动把它清理掉.其实,C盘有四个文件夹可以直接把它删除 ...

RNA-seq的fastq文件里面为什么有gc含量的双峰