使用SGSeq探索可变剪切 / 开普饭

关于 TCGA 数据库当中的可变剪切事件而言,其中最出名的还是 [[TCGA Spliceseq-可变剪切相关数据库]].在 Spliceseq 数据库当中通过 PSI 这个指标来评价了不同基因转录本 ...

可变剪切(Alternative splicing,AS)是基因转录时,通过组合不同的外显子,形成不同转录本的过程,在生命的信息传递过程中发挥着重要的作用,维持蛋白质多样性的主要机制.在不同组织或者发 ...

该软件早在2016年就公布了,发表在biorxiv预印本上面,但直到2017年的双11,才发表在NG上面,文章是 : Annotation-free quantification of RNA spl ...

关于可变剪切,简单而言就是,一个基因从DNA-mRNA的过程当中,由于剪切位点的不同,会形成不同的mRNA剪切变异体.对于可变剪切模式,之前的介绍TCGA SpliceSeq数据库的时候提到了数据库当 ...

编译:Young,编辑:Emma.江舜尧. 原创微文,欢迎转发转载. 导读可变剪接是指一个mRNA前体通过不同的剪接方式产生不同的mRNA剪接异构体.然而,在植物中蛋白质组复杂性的贡献仍然是难以捉摸 ...

异源六倍体普通小麦(又称为面包小麦)占据了小麦种植品种的95%以上,为超过三分之一的人类提供主要能量来源,小麦的产量和品质直接关系到全人类的食物安全[1].小麦白粉病是一种世界范围的真菌性病害,每年造 ...

在生物体进化过程中,基因组及其包含的基因是不断变化的.在包括小麦在内的许多作物中,多倍体事件不仅导致了显著的基因组变化,并且在植物进化过程中也不断发生.小麦作为全球最重要的主食之一,用于粮食生产的主要 ...

以后只用Rmarkdown写博客啦! 如果你想知道这样的图如何做出来了: 请直接点击下面的阅读原文阅读,省掉了图文排版时间,赞~ http://www.bio-info-trainee.com/bio ...

了解我的应该都知道我最近几个月都在奋战一个陌生的领域,单细胞转录组数据处理.真的很有挑战性,笔记累积了一大堆了,但是没有太值得分享的,大多是利用bulk转录组数据处理的经验而已,但是下面这个是单细胞转 ...

今天在全国第8届生物信息学大会有幸听到了rMATS软件开发实验室PI的演讲,正好推送一波顾兄关于rMATS这款差异可变剪切分析软件的使用体验 PPT镇楼: rMATS是一款对RNA-Seq数据进行差异 ...

使用SGSeq探索可变剪切