PCAWG计划-原发肿瘤的WGS数据整合分析 / 开普饭

所谓的泛癌分析我们都知道在TCGA数据库当中,包括了33种所有实体肿瘤的测序的结果(如果不知道的话,可以看我们今天的第二条推送哦!).我们在进行TCGA数据分析的时候,除了可以对单一的癌种进行分析之 ...

癌症是一种基因病,由体细胞癌基因突变引起.早在2001年对首个人类基因组进行测序后,肿瘤的全面基因组表征就成为癌症研究人员的一个主要目标.从那时起,测序技术和分析工具取得的进展使得这个研究领域蓬勃发展 ...

我们在进行数据库介绍,尤其是肿瘤相关数据库的时候,经常会提到说这个使用了 TCGA/GTEx 数据库的数据,那么这两个数据库到底是什么呢?为什么会有用这两个数据库呢?另外呢,由于最近ICGC提的也比 ...

如何利用ICGC数据库来寻找一个突变相关课题昨天我们介绍了ICGC来浏览PCAWG数据的基本功能.昨天的那样介绍,稍微有一些零散,所以我们可以假设一个例子来使用ICGC数据库分析一下看一看. 以下是 ...

文|陈根尽管癌症的诊断和治疗已经取得了一定程度的进步,但在很多国家,癌症仍然是导致儿童死亡的一大元凶.由于儿童时期癌症发病年龄和肿瘤生物学特性不一致,使得不同儿童期癌症具有病理学和临床表现上的异质性 ...

本讲涉及到的芯片分别是: GSE7762 GSE62346 GSE50382 视频里的示例会带领大家使用 GEOquery 包里面的getGEO函数下载每个表达芯片数据在GEO数据库里面的数据,解析获 ...

这是一份大三学生的课程实践作业~~~ 找出胶质细胞瘤特异性甲基化区域,为临床诊断提供理论依据步骤: 1.查找数据:下载TCGA中GBM的RNA-seq和甲基化数据 2.甲基化数据分析,正常肿瘤对比, ...

于2021年3月发表在CELL杂志的文章, 标题是:<In vivo CD8+ T cell CRISPR screening reveals control by Fli1 in infect ...

日前,RaySearch发布了新一代放射治疗计划系统RayStation® 7.与以往的产品相比,RayStation® 7增加了许多新的功能,其中最重要的是能够用于HYPERSCAN,并且整合了Ra ...

阑尾肿瘤的罕见性和不典型性常常导致临床工作中的漏诊和误诊,今日早教学,陆海迪主治医师从阑尾的解剖.组织学结构及伴发征象入手,层层剥离,为大家详细阐述了此类疾病.

小勤:我们每天都能收到供应商推送的pdf格式的燃油价格文件,怎么能方便地整合到一起做数据分析啊? 大海:现在Power BI支持pdf文件的数据导入了,所以非常方便啊. - 1 - 打开功能小勤:这 ...

推荐:江舜尧编译:番茄加牛腩同学编辑:小菌菌荷兰鹿特丹伊拉斯姆斯大学医学中心/英国牛津大学Nuffield人口健康学部Jun Liu和Cornelia M. vanDuijn等于2020年1月1 ...

周老师划重点 (一)2020年江苏高考总览 (二)2020江苏13市考取清北人数统计 (三)13市各校录取清北人数统计 2020年江苏高考总览去年江苏高考人数34.89万人,理科一本线为347分,线 ...

日前,澳大利亚基础服务供应商Fiber Expressway宣布在澳大利亚建造三个数据中心的计划,预计总费用为15亿澳元,折合超过75亿元人民币. 香港IDC新天域互联了解到,按照规划,三个数据中心分 ...

PCAWG计划-原发肿瘤的WGS数据整合分析