【视频讲解】- 小鼠表达芯片数据整合分析 / 开普饭

范振海邢时云冯源 [摘要]目的:采用生物信息学方法筛选出肝癌的关键差异表达基因.方法:对GEO公共数据库中获取的四组肝癌和癌旁组织基因表达芯片数据进行生物信息学分析,首先用R数据包中的limma程 ...

之前在介绍GEO数据库数据分析的时候,我们介绍过GEO2R这个在线的分析GEO芯片数据的工具.但是对于GEO里面的一些二代测序的数据,就没办法进行分析了.最近新发布了一个在线的数据库eVITTA,则可 ...

昨天我们GEO数据库的检索方式.但是对于里面的每一个数据集内容没有详细的解释,这次呢,我们就来介绍一下每个数据集里面包括哪些内容. 这次我们用GSE79973数据集进行介绍.(https://www. ...

是不是等着急了? 哈哈,不要着急,不要着急,杨哥为你们想着呢. 如果在高考期间就公布,或许会影响大家的考试心情.更何况,我们约好了的,高考期间,考一科忘一科. 现在,高考尘埃落定. 现在,该给你正确的 ...

作者是生信技能树组建的表观遗传学学习小组的小组长,前面已经发过一个: 学员分享-Chip-seq 实战分析流程本文是看到生信技能树有个450K甲基化芯片数据处理传送门,我呢,恰好不久前用一个集成度很 ...

这是一份大三学生的课程实践作业~~~ 找出胶质细胞瘤特异性甲基化区域,为临床诊断提供理论依据步骤: 1.查找数据:下载TCGA中GBM的RNA-seq和甲基化数据 2.甲基化数据分析,正常肿瘤对比, ...

TCGA的Pan-Cancer早在2013就系统性提出来并且规划好了,见Nat. Genet. 2013 45:1113), 因为TCGA计划涉及到数据类型比较多,仅仅是DNA层面就有WGS,WES, ...

RNA-seq这样的测序数据也可以的啊! 比如这篇Published: 12 March 2019的文章:Identification of Key Long Non-Coding RNAs in t ...

我这里先列出学徒作业,大家需求下载头颈癌里面的口腔癌的甲基化芯片信号值矩阵,然后挑选有N-T配对的32个病人的数据进行差异分析,就走我们介绍的champ流程即可! 理论上你掌握了这个分析策略,换成任何 ...

于2021年3月发表在CELL杂志的文章, 标题是:<In vivo CD8+ T cell CRISPR screening reveals control by Fli1 in infect ...

555定时器,从诞生到现在,销量过百亿,电路设计从没有大改变,可以说是历史上最成功的芯片. NE555双极型时基电路(555的第一代)是1972年美国Signetics公司研制出的.设计原意是用来取代 ...

小勤:我们每天都能收到供应商推送的pdf格式的燃油价格文件,怎么能方便地整合到一起做数据分析啊? 大海:现在Power BI支持pdf文件的数据导入了,所以非常方便啊. - 1 - 打开功能小勤:这 ...

【视频讲解】- 小鼠表达芯片数据整合分析