scRNA-seq原始数据的处理 / 开普饭

本文由阿童木根据实践经验而整理,希望对大家有帮助. 原创微文,欢迎转发转载. 导读本系列的上一篇推文,即"开篇"中已经描述了宏基因组研究的基本思路和方法.先回顾一下,首先是收集样 ...

导语今天和大家分享的是2020年1月份发表在SCIENTIFIC DATA杂志上的一篇文章(IF=5.929)"Single-cell RNA sequencing of human ki ...

DNA甲基化是一种非常基础且重要的表观修饰,在调控基因表达.转录因子结合和抑制转座子元件中起到关键的作用. 目前,DNA甲基化检测的技术已经比较成熟,例如高通量的WGBS.RRBS.MeDIP-seq ...

北京时间4月21日晚间,特斯拉官方微博@特斯拉发布消息称,再次感谢大家一直以来的关切.我们的专门处理小组正在全力开展工作,现将最新进展向大家汇报: 今天下午,我们已主动与郑州市市场监督管理局联系并汇 ...

转录组测序(RNA-Seq)是当下生物医学科研领域的热点技术,在SCI论文中频频亮相.但是无论是以RNA-Seq为试验主体的论文,还是以RNA-Seq为分析辅助手段的论文,在发表之前总是绕不开一个问题 ...

大家在刚开始做代谢组学时往往会遇到第一个难题就是质谱的下机原始数据不会处理的情况,当然很多仪器厂商例如Waters, Thermo, AB都有付费的商业配套软件,不过大多数实验室都没有购买.所有今天我 ...

正文处理原始scRNA-seq数据 3.3 文件格式 3.3.1 FastQC FastQ是您将遇到的最原始形式的scRNASeq数据.所有scRNASeq方案都使用配对末端测序进行测序.Barco ...

拟时(pseudotime)分析,又称细胞轨迹(cell trajectory)分析,通过拟时分析可以推断出发育过程细胞的分化轨迹或细胞亚型的演化过程,在发育相关研究中使用频率较高.主要基于关键基因的 ...

[中国没有给原始数据假设和提法不成立]中国-世界卫生组织新冠病毒溯源联合研究中方专家组组长.清华大学教授梁万年在31日的发布会上说,中外专家在武汉一直坚持四个共同原则,共同在做研究计划.共同在分析,中 ...

中国-世界卫生组织新冠病毒溯源联合研究中方专家组组长.清华大学教授梁万年在31日的发布会上说,中外专家在武汉一直坚持四个共同原则,共同在做研究计划.共同在分析,中方专家掌握的信息和外方专家掌握的信息不 ...

PCA是Principal components analysis的简称,叫做主成分分析,是使用最广泛的降维算法之一.所谓降维,就是降低特征的维度,最直观的变化就是特征的个数变少了.当然,不同于特征筛 ...

一.引言 2021年6月10日的推文在"如何获取原始数据及其空间权重矩阵?"部分的关键程序是错误的,并且遗漏了把spmat格式空间权重矩阵转换成dta格式空间权重矩阵(进行SEMD ...

作者简第一名王槐菊 12915+105+5262=18282 第二.三.四名李婷孔宪铸陈付芬 10282+120+1990=12392 5670+168+2042=7880 6915+567 ...

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