monocle2 拟时间分支点分析结果解读 / 开普饭

前面我们已经介绍了:使用monocle做拟时序分析(单细胞谱系发育) 然后回答了一个学员的问题: 拟时序分析的热图提取基因问题 , 但是因为大家对monocle包的说明书不熟悉,对R不熟练,以至于无 ...

介绍单细胞轨迹可以揭示基因调控如何控制细胞命运的决定.然而,学习具有两个或更多个分支的复杂轨迹的结构仍然是一个具有挑战性的计算问题.我们介绍了Monocle 2,它使用反向图嵌入以完全无监督的方式描 ...

昨天我在单细胞天地讲解了使用monocle2进行拟时序分析的方法,基本上跟着我的代码走一波就可以学会了,当然具体参数理解需要自行发力哦,见:使用monocle做拟时序分析(单细胞谱系发育) 用法只是最 ...

作者 | 单细胞天地小编刘小泽课程链接在:http://jm.grazy.cn/index/mulitcourse/detail.html?cid=55 这次会介绍如何对不同谱系的差异基因分类注 ...

The ganglion also consists of sympathetic efferent (postganglionic) fibers from the superior cervica ...

男, 一个长大了才会遇到的帅哥, 稳健,潇洒,大方,靠谱. 一段生信缘,一棵技能树, 一枚大型测序工厂的螺丝钉, 一个随机森林中提灯觅食的津门旅客. 前言 Garnett是一个从单细胞表达数据中实现自 ...

都介绍到单细胞转录组数据处理之细胞亚群比例比较部分了,10讲就告一段落了,大家可以回看仔细品读.后面的分析其实都是个性化的了,取决于课题设计,假说,生物学背景知识,而且需要学习大量的R包. 既然是个性 ...

回顾 Monocle2 踩坑教程(1) 差异分析差异基因表达分析是RNA-Seq实验中的一项常见任务.Monocle可以帮助你找到不同细胞群间差异表达的基因,并评估这些变化的统计显著性.这些比较要求 ...

男, 一个长大了才会遇到的帅哥, 稳健,潇洒,大方,靠谱. 一段生信缘,一棵技能树. 生信技能树核心成员,单细胞天地特约撰稿人,简书创作者,单细胞数据科学家. 空间信息在空间转录组中的运用 Giott ...

最近刷了刷植物领域单细胞文献,有一个蛮早期的拟南芥根部单细胞研究:<High-Throughput Single-Cell Transcriptome Profiling of Plant Ce ...

转眼间一年时间过去了,我们的全网第一个单细胞基础视频课程也结束了,还有点依依不舍. 不知道大家学的怎么样,我这边看起来线下学徒和实习生都学的挺好的,还有详细的笔记分享,考虑到大部分人是没有机会线下接受 ...

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