多个基因集相关性热图
相关推荐
-
科研 | J. Am. Coll. Cardiol.:血管疾病中的细胞外基质
编译:Donna,编辑:小白.江舜尧. 原创微文,欢迎转发转载. 导读 细胞外基质(Extracellular Matrix, ECM)是细胞周围由多种大分子组成的复杂网络,主要由5类物质组成,即胶原 ...
-
条件性敲除小鼠有哪些应用?
在科研中,条件性敲除小鼠的应用对探究基因或蛋白在体内作用及分子机制有着重要意义.发表在<Nature Communications>杂志上的一篇题为Hematopoietic PBX-in ...
-
西班牙研究癌症患者的3D打印水凝胶,促进T细胞产生
2020年9月3日,南极熊从外媒获悉,西班牙的研究小组已经3D打印出一种能够模仿人类淋巴结行为的水凝胶,并加速癌症患者T细胞的产生. 通过将聚乙二醇(PEG)基聚合物和抗凝血剂肝素相结合,该团队制造了 ...
-
【文献解读】这篇9.58分的文献应该好好品一品
循环肿瘤细胞细胞外基质蛋白高表达意味着肿瘤细胞由于定植而产生ECM能力增强.本研究讨论了胶原和热休克蛋白47-HSP47在EMT中高表达的现象,以及在循环肿瘤细胞中,HSP47的表达会刺激乳腺上皮细胞 ...
-
技术贴 | Excel:手把手教你如何做扩增子菌群数据与表观数据相关性热图
本文由技均根据实践经验而整理,希望对大家有帮助. 原创微文,欢迎转发转载. 扩增子是一种较为经济的微生物测序方法,时常被广大科研工作者所选择.在进行数据分析时,需要将菌群数据与表观数据做相关性分析,来 ...
-
表观调控13张图之二相关性热图看不同样本相关性
表观调控13张图之一证明基因干扰有效性 现在我们再解读一下第二张图,如果你对视频感兴趣,还是可以继续留邮箱,我们在圣诞节统一发邮件给大家全部的视频云盘链接和配套代码哈! 关于视频审查员 我把表观调控数 ...
-
如果你觉得相关性热图不好看,或者太简陋
前面的教程:混合到同一个10X样品里面的多个细胞系如何注释,我们提到了可以使用细胞系的表达量矩阵去跟细胞亚群表达量矩阵进行相关性计算. 就有粉丝提问,把单细胞亚群使用 AverageExpress ...
-
手把手演示用R绘制高颜值的相关性热图
白介素2的读书笔记,分享临床科研干货,一起见证时间的力量 [温馨提示]:pdf文件已上传至知识星球 优秀会吸引优秀 微光会吸引微光
-
文章复现丨雷达图,相关性热图,GSEA,这些高大上的图表,今天我手把手教你零代码凑一篇纯生信文章!
文章信息 要素拆解: 疾病:胰腺癌 表型:预后 数据来源:TCGA GEO 数据解读: 本文共包括9张图,[挑]作者首先锁定TPM家族,在oncomine数据库分析TPM1-TPM4 mRNA表达情况 ...
-
技术贴 | R语言:大样本多组学的相关性计算、热图绘制
本文由可爱的乔巴根据实践经验而整理,希望对大家有帮助. 原创微文,欢迎转发转载. 导读 上期介绍了利用psych包计算两组小样本的相关性并进行热图可视化,但当样本数据量非常大时,psych包会耗费的时 ...
-
技术贴 | R语言:小样本多组学的相关性计算、热图绘制
本文由可爱的乔巴根据实践经验而整理,希望对大家有帮助. 原创微文,欢迎转发转载. 导读 在多组学数据关联挖掘中,在我们筛选到目标基因集以及目标蛋白质集合或目标代谢物集合后,在进行基因与蛋白质或代谢关联 ...
-
萌新学完GEO课程复现SCI文章差异基因的热图
文章标题是:Tinagl1 Suppresses Triple-Negative Breast Cancer Progression and Metastasis by Simultaneously ...
-
为什么我代码里面选择top1000的sd基因绘制热图呢
实际上写完了这个全网最好的差异分析代码:免费的数据分析付费的成品代码 我就可以收工用来,但是永远不能低估粉丝的疑惑数量,任何一个细节都会被拿出来剖析. 比如代码里面我挑选了top1000的sd基因绘制 ...