单细胞RNA测序技术回顾（一）：Smart / 开普饭

对应原版教程第5章http://bioconductor.org/books/release/OSCA/overview.html 本小节概述了从测序到数据分析的基本流程,让我们对scRNA-seq先 ...

编译:刘娟,编辑:十九.江舜尧. 原创微文,欢迎转发转载. 导读单细胞水平的分子异质性研究技术加深了我们对包括动脉粥样硬化斑块在内的组织中细胞生物多样性的了解.现有的商业化系统能从成千上万个单细胞中 ...

在这个飞速发展的测序时代,DNA和RNA测序已经逐渐成为"实验室中的家常菜".若要评选出目前最受欢迎的一道菜,那恐怕非单细胞RNA测序莫属. 以往,研究人员通常利用RNA测序(RN ...

回顾单细胞转录组技术梳理(一) 单细胞转录组技术梳理(二) 单细胞转录组技术梳理(三) Smart-seq2 前面我们介绍了下Smart-seq技术.Smart-seq2是经Smart-seq改进的 ...

回顾单细胞RNA-seq分析介绍 Bulk vs scRNA-seq Bulk vs scRNA-seq.png Bulk RNA-seq : 它测定的是一个大的细胞群体中的每一个基因的平均表达水平 ...

前言在这之后,许多更灵敏.更准确的单细胞转录组技术如雨后春笋般相继被开发出来.今天继续来回顾一下2011年的单细胞转录组测序技术 STRT(Single-cell tagged reverse tr ...

推荐:江舜尧编译:美少女编辑:马莉美国密西根大学Euisik Yoon等学者于2019年5月15日在期刊 <Nature Communications> 上发表了<Hydr ...

文献解读 Potter, S. S. (2018).Single-cell RNA sequencing for the study of development, physiology anddis ...

编译:胡胡,编辑:景行.江舜尧. 原创微文,欢迎转发转载. 导读躯体感觉是由多种初级感觉神经元的存在定义的,这些神经元具有独特的生物学特征以及对外部和内部刺激的反应特征.然而,关于细胞状态的多样性是 ...

编译:阿温,编辑:景行.江舜尧. 原创微文,欢迎转发转载. 导读肺癌是导致癌症患者死亡的主要原因,它表现出的异质性使其具有适应性,限制了治疗的成功,且仍没有被完全了解.本研究采用30名转移性肺癌患者 ...

编译:夕夕,编辑:夏甘草.江舜尧. 原创微文,欢迎转发转载. 导读气孔谱系细胞发育的调控已被广泛研究.然而,基于单细胞转录组研究这一生物学过程还尚未报道.本文,作者主要对拟南芥5日龄的12844个单 ...

编译:小北,编辑:十九.江舜尧. 原创微文,欢迎转发转载. 导读目的:肿瘤的异质性是胃腺癌(GA)准确诊断和治疗的主要障碍.研究者在GA中利用单细胞RNA测序报道了系统的转录图谱来解释分子和细胞内的 ...

编译:小北,编辑:十九.江舜尧. 原创微文,欢迎转发转载. 导读肝脏在机体免疫防御和免疫耐受中发挥重要作用.肝脏上的免疫细胞(LrICs)决定免疫特性,但是这些细胞独特的组成和异质性尚未完全掌握.本 ...

单细胞RNA测序技术回顾（一）：Smart