单细胞RNA测序技术之入门指南 / 开普饭

编译:微科盟刘娟,编辑:微科盟景行.江舜尧. 原创微文,欢迎转发转载. 导读生物学和药理学研究的基础是揭示空间尺度的细胞异质性.组织功能和结构.与传统单分子或大数据组学方法不同,尖端的空间转录组学技 ...

本课程学习目标描述设计单细胞RNA-seq实验的最佳实践描述单细胞RNA-seq分析的工作流程步骤使用Seurat和相关工具来执行单细胞表达数据的分析,包括数据过滤,QC,整合(降维),聚类和标 ...

在前面的<浅谈流式细胞仪的工作原理和应用>一文发布以后,小编发现有好学的热心盆友留言要求出一期单细胞测序的文章,那么我们今天就给大家介绍点与单细胞测序相关的知识. 单细胞测序一直是科学家关 ...

回顾单细胞RNA-seq分析介绍 Bulk vs scRNA-seq Bulk vs scRNA-seq.png Bulk RNA-seq : 它测定的是一个大的细胞群体中的每一个基因的平均表达水平 ...

简介单细胞测序技术,简单来说,就是在单个细胞水平上,对基因组.转录组及表观基因组水平进行测序分析的技术.传统的测序,是在多细胞基础上进行的,实际上得到的是一堆细胞中信号的均值,丢失了细胞异质性(细胞 ...

编译:夕夕,编辑:十九.江舜尧. 原创微文,欢迎转发转载. 导读 RNA测序(RNAseq)是生命科学领域最常用的技术之一,已广泛用于癌症研究,药物开发以及癌症诊断和预后.在各种生物学和技术问题的推动 ...

二代测序平台的出现,使得从组织.生物体液和细胞外囊泡中发现和找到有意义的RNA变得更容易.最近,研究者们开始喜欢在在被称为外泌体(exosomes)的细胞外囊泡里找到RNA并测序,因为它们在细胞间联系 ...

传统的基因表达研究,从芯片到RNA测序,无不依靠数百万个细胞才能开展.然而,考虑到细胞群体的异质性,这种简单的平均值当然无法满足科学家的需求.不同类型的细胞采用独特的基因组合来表达蛋白质,即使是同一类 ...

编译:刘娟,编辑:十九.江舜尧. 原创微文,欢迎转发转载. 导读单细胞水平的分子异质性研究技术加深了我们对包括动脉粥样硬化斑块在内的组织中细胞生物多样性的了解.现有的商业化系统能从成千上万个单细胞中 ...

推荐:江舜尧编译:美少女编辑:马莉美国密西根大学Euisik Yoon等学者于2019年5月15日在期刊 <Nature Communications> 上发表了<Hydr ...

文献解读 Potter, S. S. (2018).Single-cell RNA sequencing for the study of development, physiology anddis ...

编译:胡胡,编辑:景行.江舜尧. 原创微文,欢迎转发转载. 导读躯体感觉是由多种初级感觉神经元的存在定义的,这些神经元具有独特的生物学特征以及对外部和内部刺激的反应特征.然而,关于细胞状态的多样性是 ...

编译:阿温,编辑:景行.江舜尧. 原创微文,欢迎转发转载. 导读肺癌是导致癌症患者死亡的主要原因,它表现出的异质性使其具有适应性,限制了治疗的成功,且仍没有被完全了解.本研究采用30名转移性肺癌患者 ...

编译:夕夕,编辑:夏甘草.江舜尧. 原创微文,欢迎转发转载. 导读气孔谱系细胞发育的调控已被广泛研究.然而,基于单细胞转录组研究这一生物学过程还尚未报道.本文,作者主要对拟南芥5日龄的12844个单 ...

编译:小北,编辑:十九.江舜尧. 原创微文,欢迎转发转载. 导读目的:肿瘤的异质性是胃腺癌(GA)准确诊断和治疗的主要障碍.研究者在GA中利用单细胞RNA测序报道了系统的转录图谱来解释分子和细胞内的 ...

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