单细胞实战(二) cell ranger使用前注意事项 / 开普饭

NGS数据分析实践:06. 数据预处理 - 序列比对+PCR重复标记+Indel区域重比对+碱基质量重校正目录 1. 序列比对 1.1 参考基因组建索引 1.2 序列比对 2. 排序 3. PCR重 ...

本系列想详细的梳理NGS数据分析中常用的几种数据格式,目前打算见下图: 正文分割线 FASTQ和FASTA是存储DNA序列及对应质量信息最常使用的文本文件,本文介绍Illumina平台下机数据FAST ...

在前面的<浅谈流式细胞仪的工作原理和应用>一文发布以后,小编发现有好学的热心盆友留言要求出一期单细胞测序的文章,那么我们今天就给大家介绍点与单细胞测序相关的知识. 单细胞测序一直是科学家关 ...

简介目前10X单细胞测序算是测序行业最热门的方向之一,它可以在低测序深度的情况下一次性的获得成千上万的细胞及其每个细胞内的基因表达情况,对了解细胞异质性和新的细胞类型非常有利.官网介绍的功能和优势如下 ...

Cell Ranger是一个10X genomics公司的单细胞分析软件,将原始的fastq文件生成后续分析的feature-barcode表达矩阵.其中包括很多模块,本次主要介绍cellranger ...

简介单细胞测序技术,简单来说,就是在单个细胞水平上,对基因组.转录组及表观基因组水平进行测序分析的技术.传统的测序,是在多细胞基础上进行的,实际上得到的是一堆细胞中信号的均值,丢失了细胞异质性(细胞 ...

实战演练理论知识学再好,能付诸实践灵活运用才行,所以我们常强调知行合一,实践出真知.实战演练这个栏目就是带大家从头到尾完整复现单细胞文献分析流程.好了,干货多,屁话少,我们来看实战流程. 希望大家能 ...

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2021年3月份,牵引车市场创造了超12万辆的历史新纪录,这个前无古人的纪录能保持多久呢?4月份,牵引车市场能否像重卡市场一样把连增势头延续下去呢? 请看第一商用车网带来的分析报道. 第一商用车网最新 ...

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秋风起,秋意浓,秋天那么美,生活那么好,你却没有健康的身体"享受",是不是一种遗憾?有句话说,血管多大寿,人就活多久,仔细想想这话是有很大道理的,血管贯穿于全身上下,一旦血管出现问 ...

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单细胞实战(二) cell ranger使用前注意事项