Nucleic Acids Research 在线发表癌症miRNA组学数据库CancerMIRNome / 开普饭

看你们都无心看文献,那就给你们看看神奇工具吧 ,今天给你们讲的这个--就是--微型电视机-- 卖身契许冠杰 - 钜片名曲选呃,实际上就是一个miRNA的小工具, 其实还蛮有意思的-- 首先随便输入 ...

miRTarBase miRTarBase(http://mirtarbase.mbc.nctu.edu.tw/php/index.php)也是一个基于实验基础的 miRNA 绑定基因查询数据库.不同 ...

我们熟知,在特定情况下,microRNA(miRNA)可以直接或间接激活和抑制基因表达.但是,尚没有基于多组学的数据库能够证明对激活与抑制以及正常与癌症状况之间相互作用模式转换的系统数据.今天我们为大 ...

miRNA作为ncRNA的一类.其主要发挥功能的主要方式是通过和基因形成双向互补链进而来影响基因的表达.因此通过miRNA和基因序列是否互补就可以遇到miRNA可能的靶基因了.这个基本上就是经典的预测 ...

该数据是我自己下载整理过的数据. 下载日期:2021年8月25日下载方式:TCGAbiolinks包数据类型:RData 变量名称:mir_Count:mir_RPM path <- dir ...

之前我们介绍了很多TCGA方面的数据库.其中GEPIA只能用来分析表达数据库各个方面的.cBioPortal可以进行多组学分析,但是一般都是分析自身基因和自身突变等等的关系.至于CVCDAP分析的则是 ...

UALCAN:(http://ualcan.path.uab.edu/index.html)是一个综合的.用户友好的.交互式的web资源,用于分析癌症组学数据.UALCAN的设计目的是: 提供对公开的 ...

该数据是我自己下载整理过的数据. 下载日期:2021年7月12日下载方式:TCGAbiolinks包数据类型:RData 变量名称:expDataTPM > ##加载数据,数据对象是一个数据 ...

编译:Nicole,编辑:十九.江舜尧. 原创微文,欢迎转发转载. miRNA是20-22nt的非编码RNA,在生物学过程中参与对靶标的转录后沉默.植物通过Dicer-like(DCL)1蛋白从具有特 ...

编译:不二,编辑:十九.江舜尧. 原创微文,欢迎转发转载. 导读基因表达模式分析的多重RNA原位杂交在研究发育和疾病中起着重要作用.本研究展示了一种多重RNA-ISH检测组织切片中肿瘤空间异质性的方 ...

编译:夕夕,编辑:十九.江舜尧. 原创微文,欢迎转发转载. 导读单细胞转录组学为推断细胞网络中配体受体(LR)的相互作用提供了前所未有的机会.本文介绍了一种新的LR数据库和一种新的正规化评分来执行这 ...

编译:不二,编辑:十九.江舜尧. 原创微文,欢迎转发转载. 美国哈佛大学干细胞和再生生物学研究所及哈佛医学院布拉瓦尼克研究所Paola Arlotta和Constance L. Cepko等人于201 ...

加拿大学者Kerrin Mendler等人于2019年4月9日在<Nucleic Acids Research>上发表题目为<AnnoTree: visualization and ...

长非编码RNA(long non-coding RNA,lncRNA)是一类长度大于200nt的非编码RNA.大量研究表明,lncRNA具有重要的调控功能,在植物和动物的各种生物学过程中起着重要作用. ...

Nucleic Acids Research [IF:11.501] HMPDACC: a Human Microbiome Project Multi-omic data resource HMPD ...

对于肿瘤细胞系的分析,之前我们介绍过 .但是随着CCLE系统的升级.之前介绍的一些功能基本上也用不了.按照之前的帖子,我们在进入CCLE网址之后,界面变成了下面的这个样子.所以为了更好的时候使用CCL ...

编译:杨丽军,编辑:Emma.江舜尧. 原创微文,欢迎转发转载. 导读近年来,在哺乳动物基因组中发现了大量的长非编码RNA(lncRNAs).最近的研究指出lncRNAs是生物学基本方面的调节因子, ...

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