miRNA与基因互作数据库 / 开普饭

导语今天和大家分享的是2019年2月份发表在Thorax杂志上的一篇文章(IF=10.844)"Gene correlation network analysis to identify ...

结直肠癌是最常见的癌症之一,miRNA的异常表达与结直肠癌的起始和发展相关.近日,来自南京医科大学的研究人员在Cell Death & Disease杂志发表论文,发现miR-486-5p在结 ...

解螺旋公众号·陪伴你科研的第2533天 7+纯生信ceRNA文章复现在pubmed搜索ceRNA,发现很多实验类的文章,做了很多内容,但是只发了2-3分,所以今天想和大家一起学习2021年1月发表于 ...

该数据是我自己下载整理过的数据. 下载日期:2021年8月25日下载方式:TCGAbiolinks包数据类型:RData 变量名称:mir_Count:mir_RPM path <- dir ...

miRNA作为ncRNA的一类.其主要发挥功能的主要方式是通过和基因形成双向互补链进而来影响基因的表达.因此通过miRNA和基因序列是否互补就可以遇到miRNA可能的靶基因了.这个基本上就是经典的预测 ...

SomamiR是microRNA(miRNA)及其靶点中癌症体细胞突变的数据库,集成了多种类型的数据,用于研究体细胞和种系突变对癌症中miRNA功能的影响.数据库还提供了存在miRNA靶序列体细胞突变 ...

俗话说,好记性不如烂笔头,小编痛定思痛,决定先整理一份miRNA相关数据库的保姆级教程分享给大家,说不定哪天就用上了呢.好,上正餐! 1. TargetScan:http://www.targetsc ...

miRTarBase miRTarBase(http://mirtarbase.mbc.nctu.edu.tw/php/index.php)也是一个基于实验基础的 miRNA 绑定基因查询数据库.不同 ...

基于KEGG数据库中蛋白和蛋白之间的相互作用关系,构建基因的相互作用网络图,而基因共表达网络根据基因在样本中的信号表达值,利用基因间的(相关系数)来拟合基因的无标度网络关系,构建基因间的共表达网络,将 ...

基因与环境互作 1. 环境「参考:」 ❝ http://www.isbreeding.net/common/UploadFiles/file/teaching/%E6%95%B0%E9%87%8F% ...

各位小伙伴,大家好,今天向大家介绍一款简单好用的功能富集分析/靶基因预测的软件-FunRich. FunRich (Functional Enrichment analysis tool) 是一个主要 ...

导语 TargetScan是一款预测miRNA结合位点的软件,对于哺乳动物中miRNA结合位点预测的效果非常好.在预测miRNA靶基因之前,首先需要确定转录本的3'UTR区域,TargetScan数据 ...

这个网站作图有多好? 官网图例分析报告模仿科研论文的格式来展现分析结果,图文并茂,对生物学者极其友好: 报告中详细阐述了分析方法和图形的意义,而且图形都含可以发表的高清晰文件格式: 报告还提供了格式 ...

蛋白质互作网络(Protein-Protein Interaction Networks,PPI) 是由蛋白通过彼此之间的相互作用构成,来参与生物信号传递.基因表达调节.能量和物质代谢及细胞周期调控等 ...

好啦,小伙伴们,上次咱们刚介绍过神器starbase,那么今天咱们再来学习一下另一款神器:miRWalk(http://mirwalk.umm.uni-heidelberg.de/).在咱们预测的时候 ...

写在前面对于miRNA靶基因的预测而言,目前有很多数据库都可以做.这些数据库的区别基本上在于纳入的数据量以及预测的算法不同.预测的结果总是有一些不同的,所以也就导致各个数据库的结果可能不是很一样.我 ...

有的小盆友,还是没有想通,要怎么样才能把自己的基因扯上明星分子. 这种间接作用靠不靠谱啊?或者说这种相关性能说明有相互作用么?或者说,他们直接有没有直接相关性呢? 好吧,大家要知道的是,大多数的蛋白相 ...

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