个性化功能富集和互作网络的王者—

我们研究一个基因的时候,首先还是要知道这个基因的功能的.之前介绍很多数据库都可以用来查询基因的功能.比如最经典的genecards数据库介绍或者ncbi-gene数据库介绍在这两个基因综合信息查询数据 ...

在之前进行富集分析介绍的时候,我们提到过关于富集分析是什么,以及富集分析的算法主要有哪些.在这么多的算法在进行富集分析的时候,就会让我们产生这样的疑问,那么多算法当中到底哪个更好呢?我在做完富集分析之 ...

我们在基因研究的时候,需要提前预测这个基因的功能是什么.编码基因可以通过其基因的蛋白结构来预测到主要功能是什么.但是对于长链非编码RNA(lncRNA)的功能,由于其不编码蛋白.这样功能预测的就不适用 ...

导语 Vesiclepedia是一个EVs分子数据(脂质.RNA和蛋白质)的手工检索数据库,目前包含来自于过去一些年份文献中发表的341个独立研究的35264个蛋白,18718个mRNA,1772个m ...

我们有时候在做mircoRNA芯片分析的时候.经常能分析得到很多候选地mircoRNA,那么对于这些miRNA怎么选择呢?他们之间是否存在功能上的相似性?这个时候就可以用到MISIM数据库了. MIS ...

参考文章题目:Identification of biomarkers and construction of a microRNA‑mRNA regulatory network for clear ...

昨天我们介绍了ConsensusPathDB的基本功能以及其在蛋白相互作用查找当中的使用.今天我们继续把ConsensusPathDB剩下的功能来进行介绍.2. 基因富集分析2.1 数据库输入对于这类 ...

五一劳动节,连续五天,在钉钉群直播互动授课带领大家系统性掌握cytoscape软件的使用方法和技巧,课程已经结束啦.文末有录播回放学习方式,以及配套授课资料! 下面是cytoscape讲师的笔记一. ...

基于KEGG数据库中蛋白和蛋白之间的相互作用关系,构建基因的相互作用网络图,而基因共表达网络根据基因在样本中的信号表达值,利用基因间的(相关系数)来拟合基因的无标度网络关系,构建基因间的共表达网络,将 ...

撰文:存在一棵树 IF=38.637 推荐度:⭐⭐⭐⭐⭐ 亮点: 通过15650次免疫沉淀构建了两个蛋白质组规模的细胞系特异性相互作用网络,该网络对相互作用组进行建模,通过相互作用组的结构编码蛋白质功 ...

王一在病原菌侵染植物的过程中,一些病原菌会分泌效应蛋白到宿主细胞中,抑制宿主的防卫反应.过去对效应因子的研究往往仅针对单个效应因子.研究个别效应因子的功能可以帮助我们深入探索病原菌与植物互作的机制, ...

●STRING数据库介绍 ● 做科研的时候,为了研究蛋白之间的相互作用网络,我们需要借助一些蛋白质相互作用数据库,而string(Search Tool for the Retrieval of In ...

hello大家好,小月亮又和大家见面了.上篇软文小月亮给大家介绍了NetworkAnalyst3.0工具的概览.这次小月亮就给大家详细介绍NetworkAnalyst3.0工具如何对单.多个基因列表数 ...

蛋白质互作网络(Protein-Protein Interaction Networks,PPI) 是由蛋白通过彼此之间的相互作用构成,来参与生物信号传递.基因表达调节.能量和物质代谢及细胞周期调控等 ...

这个网站作图有多好? 官网图例分析报告模仿科研论文的格式来展现分析结果,图文并茂,对生物学者极其友好: 报告中详细阐述了分析方法和图形的意义,而且图形都含可以发表的高清晰文件格式: 报告还提供了格式 ...

编译:小北,编辑:景行.江舜尧. 原创微文,欢迎转发转载. 导读基本原理:FOXA1是乳腺癌.肺癌以及前列腺癌起始和发展过程中关键的转录因子.之前对FOXA1转录调控网络的研究主要聚焦于蛋白编码基因 ...

个性化功能富集和互作网络的王者——FunRich数据库