【直播】我的基因组39：从bam中提取我们的原始测序数据 / 开普饭

bwa使用Burrows–Wheeler Transform (BWT)算法,利用backward搜索,针对不同reads长度,有三种算法「BWA-backtrack」, 「BWA-SW」和「B ...

NGS数据分析实践:06. 数据预处理 - 序列比对+PCR重复标记+Indel区域重比对+碱基质量重校正目录 1. 序列比对 1.1 参考基因组建索引 1.2 序列比对 2. 排序 3. PCR重 ...

Harvard FAS Informatics出品的ATAC-seq测序指南 github链接:harvardinformatics/ATAC-seq 参考文献:ATAC-seq: A Method ...

由于我是分期付款,所以我先拿到了我的测序数据的质控结果和比对情况分析报告,需要补齐全款后才能拿到原始测序数据!(中间还出了个小意外,打款的时候不小心多打了30块钱!(⊙o⊙)-不过多打的30块钱想拿回 ...

我们在之前说到过bam文件还有55G大小,这样的文件,在很多时候都不方便查看和转移.而有些时候,我们只需要我们的测序数据在全基因组的测序深度这一个值,并不需要具体某条reads的碱基序列,碱基质量值. ...

[TOC] 写在前面这是对宏基因组提取扩增子序列16S分析的第二部分,这部分将核糖体RNA基因组装后进行分析.上一节我们使用了 bbmap提取了核糖体序列,但是单纯用于ASV的方法聚类是不行的,以为 ...

全部样本全部样本混合拼装 mkdir ./assemblyall/ megahit --continue --out-dir ./assemblyall/megahit/ -m 0.9 -t 6 - ...

[toc] 写在前面从宏基因组中提取核糖体DNA序列,进行扩增子分析.扩增子数据的分析我们已经熟悉的非常熟悉了,只是从宏基因组中得到,这个过程不够熟悉.其次你以为直接提取出来的序列,直接上vseea ...

俗话说"一山容不得二虎",<跑男>节目中都是老爷们,只有baby和宋雨琦两个女生,自然话题不断.宋雨琦直播烟嗓好绝,baby空降直播间,粉碎<跑男>中关系不 ...

直播回顾 4月17日晚上7点30,全国自主教育联盟暨自主学习研究院再次面向广大学生,家长和一线老师们推出主题为"阅读中的春花古诗:教你提升自主写作小妙招"的专家免费直播讲座,本次讲 ...

"看的时候我很激动,激动的点是<Gwalla>这首歌从头到尾都是我一个人去弄的,我就觉得我的用心被这个创作人小哥哥看到了,很多点都被他讲出来了--我一共做了50遍,到第35遍的时 ...

【直播】我的基因组39：从bam中提取我们的原始测序数据