Cell | 基因表达变化和群落周转差异塑造了全球海洋宏转录组
相关推荐
-
科研 | SBB:宏基因组学等多组学联合揭示了磷酸盐的添加通过抑制微生物的生长从而增加了热带森林土壤的呼吸作用
编译:艾奥里亚,编辑:小菌菌.江舜尧. 原创微文,欢迎转发转载. 导读 热带生态系统是大气CO2的重要汇,但植物的生长受到磷(P)有效性的制约.虽然土壤微生物菌群促进了有机磷的周转和无机磷的活化,但它 ...
-
科研 | ISME:硝化螺菌群的功能多样性主导着污水处理厂生物反应器微生物群落
编译:国民少女,编辑:小菌菌.江舜尧. 原创微文,欢迎转发转载. 导读 废水中含有大量的铵,铵的存在可能会导致水体富营养化.耗氧量增加.也会威胁到水生动物的健康.而硝化作用(通过亚硝酸盐将铵氧化为硝酸 ...
-
科研 | 浙江大学Environmental Pollution:农用杀菌剂增加了温室土壤抗生素抗性基因的丰度
编译:红皇后,编辑:小菌菌.江舜尧. 原创微文,欢迎转发转载. 导读 温室作物种植中长期使用杀菌剂导致其在土壤中的残留污染问题,同时会改变土壤微生物群落结构组成,然而,目前还不清楚这些残留的杀菌剂是否 ...
-
科研 | ISME:儿童克罗恩患者粪便胆汁酸与微生物组群落结构之间的关系
编译:小鹿同学,编辑:小菌菌.江舜尧. 原创微文,欢迎转发转载. 导读 肠道微生物组的群落结构与克罗恩病(CD)的发展及其对治疗后的反应息息紧密相关.胆汁酸(BAs)在调节肠道免疫反应中发挥着核心作用 ...
-
SBB | 森林生态系统恢复过程中土壤宏基因组内微生物功能基因的变化
推荐:董小橙 编译:郭修诚 编辑:董小橙 美国弗吉尼亚理工大学的学者Shan Sun 和Brian D. Badgley于5月6日在Soil Biology and Biochemistry 杂志上发 ...
-
科研 | 弗吉尼亚理工大学Sun Shan:森林生态系统恢复过程土壤宏基因组中微生物功能基因的变化
本文由bioshepherd编译,十九.江舜尧编辑. 原创微文,欢迎转发转载. 导读 作为众多生态过程的重要调节者,土壤微生物在干扰后的生态系统恢复中发挥着重要作用.第二代测序技术已经广泛应用于研究生 ...
-
科研 | Cell:宏基因组和宏转录组共同揭示了基因表达的改变和群落的更替塑造了全球海洋宏转录组
编译:jiee,编辑:小菌菌.江舜尧. 原创微文,欢迎转发转载. 导读 海洋微生物群落极大地影响着地球的生物地球化学循环.食物网和气候.尽管最近在理解海洋微生物的物种和基因组组成方面取得了进展,但对其 ...
-
科研 | Cell:人肠道菌群如何对药物进行代谢
编译:莫沉,编辑:小菌菌.江舜尧. 原创微文,欢迎转发转载. 导读 人体肠道微生物中含有大量的具有不同生化能力的细菌.现有的文献已经报导了许多药物可以被肠道微生物中的单个菌株代谢.然而,目前在整个微生 ...
-
Water Research | 宏基因组和16S扩增子测序揭示了环境温度下添加过氧化钙对剩余污泥厌氧发酵性能的影响(国人作品)
推荐:江舜尧 编译:Hancactus 编辑:小菌菌 近日,同济大学环境科学与工程学院污染控制与资源化研究国家重点实验室李咏梅教授团队在环境科学与生态学顶级期刊Water Research(一区TOP ...
-
科研 | ENVIRON INT:塑料是海洋环境中抗生素和金属耐药基因(ARGs和MRGs)的重要传播和扩散载体(国人作品)
编译:黎昕远航,编辑:十九.江舜尧. 原创微文,欢迎转发转载. 导读 塑料正以前所未有的规模在近海和深海中积累,其污染受到人们的高度关注.微塑料的高比表面积增加了其对污染物和有机质的吸附能力,同时其疏 ...
-
科研 | Microbiome:牙刷微生物群是口腔微生物群与环境微生物群的交汇点
编译:微科盟如风,编辑:微科盟木木夕.江舜尧. 微科盟原创微文,欢迎转发转载. 导读 尽管室内微生物群影响着我们的健康和福祉,但一旦人类微生物群从人类宿主转移出去,就会发生分类和功能转变,在这一方面仍 ...
-
科研 | 氧化还原特性表征了全球微生物群落的组织特征
本文由沐秋编译,董小橙.江舜尧编辑. 原创微文,欢迎转发转载. 导 读 生物群落的结构通常指分类单元的概况,其生态功能被认为是已知的,或者至少是可预测的.然而,在环境微生物学中,大多数微生物的功能是 ...
-
科研 | Microbiome:微生物群落功能预测的准确性与样本类型和功能类别的关系
编译:红皇后,编辑:小菌菌.江舜尧. 原创微文,欢迎转发转载. 导读 尽管近些年测序的成本不断的下降,鸟枪宏基因组测序的价格依然要远高于16S rRNA扩增子测序,因此研究人员开发了多种基于微生物群落 ...
-
科研 | Nature Communications:景观地形构建了北极多边形冻原的土壤微生物群落
本文由殷继忠编译,董小橙.江舜尧编辑. 原创微文,欢迎转发转载. 导读 本文对阿拉斯加的低温多边形景观中土壤微生物群落横向和纵向的功能潜力进行探究.比较宏基因组学.新微生物的基因组分析和气体流量,结果 ...
-
综述 | Nature子刊:微生物组学研究方法,看这一篇就够了(IF:31.851)
本文由卡内斯坦编译,董小橙.江舜尧编辑. 原创微文,欢迎转发转载. 导读 微生物组学研究主要涉及两方面技术:测序技术和数据分析技术.近年来,这两方面技术都在不断进步.如何为自己的研究选择恰当的技术方法 ...
-
宏转录组专题 | 8个样本发9分PNAS:宏转录组 PK 宏基因组
本文由阿童木根据实践经验而整理,希望对大家有帮助. 原创微文,欢迎转发转载. 导读 这篇文章仅仅纳入了8个检测对象,但是作者用这屈指可数的样本不仅分析了冷冻.乙醇.RNAlater三种保存方法对标本的 ...
-
Water Research | 宏基因组学揭示了在不同氮负荷速率下厌氧氨氧化反应器微生物群落的差异导致硝酸盐产量的差异
推荐:江舜尧 编译:小菌菌 编辑:小菌菌 华东理工大学刘勇弟组近期于Water Research上发表了题名为<Metagenomics reveals microbial community ...
-
科研 | SBB:基于扩增子、宏基因组序列预测微生物群落代谢特征
编译:橙,编辑:小菌菌.江舜尧. 原创微文,欢迎转发转载. 导读 随着代谢组学技术的发展,尤其是以人类肠道中的微生物群落代谢组学为代表,为人们了解疾病患者体内被破坏的功能和稳态,分析不同调节途径之间的 ...