宏转录组专题 | 8个样本发9分PNAS：宏转录组 PK 宏基因组

相关推荐

• 科研| Theranostics：宏基因组和代谢组学分析揭示了不同严重程度的慢性肾脏疾病中肠道微生物特征

  编译:Mendelsohn,编辑:谢衣.江舜尧. 原创微文,欢迎转发转载. 导读 慢性肾脏病(CKD)是一种严重的疾病,与肠道菌群和循环代谢的特定变化有关.然而,CKD微生物的功能与疾病不同阶段宿主代 ...

• 科研 | Nat. Med.：宏基因组和代谢组分析揭示肠道菌群明显的结直肠癌阶段性特异表型

  编译:北越城主,编辑:Emma.江舜尧. 原创微文,欢迎转发转载. 导读 在大多数散发性结直肠癌病例中,肿瘤发生是一个多步骤过程,涉及基因组改变和形态学改变.越来越多的证据表明人类肠道微生物组与大肠癌 ...

• MetaGEM：直接从宏基因组重建基因组规模的代谢模型

  基因组规模代谢网络模型(Genome-scale metabolic model,GEM),是一种包含了某种特定生物或者是细胞基因组范围代谢反应,及其酶及基因关联的数学模型. 这里,我们基于文章的描述 ...

• 陈卫院士等13.5分综述：详解'sIgA包被肠菌'与婴儿健康| 热心肠日报

  今天是第1738期日报. 陈卫.杨波等:sIgA包被肠道细菌与生命早期健康(综述) Trends in Microbiology[IF:13.546] ① 肠道内分泌型免疫球蛋白A包被(sIgA+)的 ...

• 免疫预后模型+自测样本发8分

  导语 今天和大家分享的是2020年10月份发表在Theranosics杂志上的一篇文章"An immune cell infiltration-based immune score mode ...

• 如何用少量临床样本发9分顶刊

  Transcriptional profiling identifies an androgen receptor activity-low, stemness program associated ...

• 技术贴 | 宏转录组专题 | 盘点宏转录组分析方法

  本文由阿童木根据实践经验而整理,希望对大家有帮助. 原创微文,欢迎转发转载. 导读 宏转录组 宏转录组测序是对某一特定时期.特定环境样品中的全部微生物的RNA进行高通量测序,直接获得该环境中所有微生物 ...

• 技术贴 | 宏转录组专题 | DDBJ数据库：宏转录组测序数据下载

  本文由阿童木根据实践经验而整理,希望对大家有帮助. 原创微文,欢迎转发转载. 导读 DDBJ(DNA Data Bank of Japan)是与NCBI的GenBank,EMBL的EBI数据库齐名的世 ...

• 宏基因组分析专题（1）：生物信息学的开始-Linux系统的安装教程

  本文由微科盟phage根据实践经验而整理,希望对大家有帮助. 微科盟原创微文,欢迎转发转载. 写在前面 什么是宏基因组测序以及分析? 简单来说就是提取我们样品中总DNA并进行二代测序,测序后需要对测序 ...

• 【汉和铜箔冠名】发力乘用车市场，微宏未来将推出350wh/kg产品

  摘要:3月20日,起点锂电大数据百强锂电企业全国寻访团走进微宏动力,与公司相关负责人就公司发展及行业问题进行了交流探讨. 起点研究院(SPIR )数据显示,2018年国内新能源乘用车电池总装机量为33 ...

• 宏基因组分析专题（2）：生物信息学软件的应用市场-Conda的安装流程

  本文由微科盟phage根据实践经验而整理,希望对大家有帮助. 微科盟原创微文,欢迎转发转载. 写在前面 什么是Conda? Conda是一款可以帮助我们轻松安装几乎所有的生物信息学软件的工具,说Con ...

• 宏基因组分析专题（3）：宏基因组数据的质控-fastQC和Trimmomatic的安装和使用

  本文由微科盟phage根据实践经验而整理,希望对大家有帮助. 微科盟原创微文,欢迎转发转载,转载须注明来源<微生态>公众号. 写在前面 为什么要质控?   宏基因组测序一般用的是illum ...

• 宏基因组分析专题（4）：宏基因组拼接的高效工具：megahit的安装和使用

  本文由微科盟phage根据实践经验而整理,希望对大家有帮助. 微科盟原创微文,欢迎转发转载,转载须注明来源<微生态>公众号. 在上一节"宏基因组分析专题(3):宏基因组数据的质控 ...