技术贴 | 宏转录组专题 | DDBJ数据库：宏转录组测序数据下载

相关推荐

• 8-跟着science学习宏基因组-从宏基因组中提取16S序列分析3-barrnap提取核酸序列-组装注释

  全部样本 全部样本混合拼装 mkdir ./assemblyall/ megahit --continue --out-dir ./assemblyall/megahit/ -m 0.9 -t 6 - ...

• 0-跟着science学宏基因组-背景和数据

  写在前面 首先说几句话: 本小结代码不需要运行,只是告诉大家数据来源和这份代码的来源: 本小结的软件也不需要安装. 如果没有Ubuntu的随便安装一个就可以16-20都可以运行,例如: 下载一个Qii ...

• 技术贴 | 微生太宏基因组报告解读 | 第一篇：测序数据过滤

  本文由阿童木根据实践经验而整理,希望对大家有帮助. 原创微文,欢迎转发转载. 导读 本系列的上一篇推文,即"开篇"中已经描述了宏基因组研究的基本思路和方法.先回顾一下,首先是收集样 ...

• sra数据库的fastq测序数据已经同步到亚马逊云了

  四年前我写过介绍GEO和SRA数据库的推文 : 解读GEO数据存放规律及下载,一文就够 解读SRA数据库规律一文就够 其实就是耗费一点时间去摸索如何在这两个数据库里面查询下载自己感兴趣的文章的数据.注 ...

• 说清楚你的单细胞转录组课题多少个样品，测序数据量如何

  现在发布一个优秀学员根据我的视频教程写的10个笔记,连载,希望可以从某种程度上面帮助你更好的学习我的7个小时34集的单细胞转录组数据处理视频.当然了,如果你确实没有时间学习数据处理细节,也可以委托生信 ...

• 技术贴 | 宏转录组专题 | 盘点宏转录组分析方法

  本文由阿童木根据实践经验而整理,希望对大家有帮助. 原创微文,欢迎转发转载. 导读 宏转录组 宏转录组测序是对某一特定时期.特定环境样品中的全部微生物的RNA进行高通量测序,直接获得该环境中所有微生物 ...

• 技术贴 | 宏基因组专题 | 组装工具盘点和比较

  本文由阿童木根据实践经验而整理,希望对大家有帮助.原创微文,欢迎转发转载.导读宏基因组组装工具非常多.如何从众多组装工具中选择适合分析自己的宏基因组测序数据的工具呢?为了解决这个问题,我搜集了宏基因组 ...

• 技术贴 | 宏基因组专题 | 宏基因组分箱(Binning)技术

  本文由阿童木根据实践经验而整理,希望对大家有帮助. 原创微文,欢迎转发转载. 导读 宏基因组分箱(Binning)是将宏基因组测序得到的混合了不同生物的序列或序列组装得到的contigs按物种分开归类 ...

• 宏转录组专题 | 8个样本发9分PNAS：宏转录组 PK 宏基因组

  本文由阿童木根据实践经验而整理,希望对大家有帮助. 原创微文,欢迎转发转载. 导读 这篇文章仅仅纳入了8个检测对象,但是作者用这屈指可数的样本不仅分析了冷冻.乙醇.RNAlater三种保存方法对标本的 ...

• 宏基因组分析专题（1）：生物信息学的开始-Linux系统的安装教程

  本文由微科盟phage根据实践经验而整理,希望对大家有帮助. 微科盟原创微文,欢迎转发转载. 写在前面 什么是宏基因组测序以及分析? 简单来说就是提取我们样品中总DNA并进行二代测序,测序后需要对测序 ...

• 科研 | Molecular Ecology Resources：SCycDB--硫循环途径宏基因组分析的功能基因数据库

  编译:独世,编辑:木木夕.江舜尧. 原创微文,欢迎转发转载. 导读 微生物在硫的生物地球化学循环中起着重要作用,硫是地球生物圈中的重要元素.鸟枪法宏基因组测序为我们进一步了解参与硫循环的微生物群落开辟 ...