0-跟着science学宏基因组-背景和数据 / 开普饭

距离公布要带500个优秀本科生入门生物信息学的活动不到一个月,虽然真正入选不到一百,但是培养成绩喜人,出勤率接近百分之百,大部分人在短短两个星期就完成了R基础知识学习,Linux认知,甚至看完了转录组 ...

其实这一讲只是把未比对到人类基因组的序列快速比对到细菌基因组,并得到各个种类的菌的占比. 在这之前我们讲的是对几亿条reads定位到指定参考基因组的具体某个坐标,那是因为我们预先知道那些reads来自 ...

conda 如何创建.查看.删除py的虚拟环境: (补充: conda国内源配置可参考:https://blog.csdn.net/suiyueruge1314/article/details/10 ...

还省掉了几百块钱的会员费!!! 最近有粉丝求助,说自己已经耗费十多天了还没有把一个NT数据库下载下来,不得已充值会员费希望可以加速,但是效果也很惨淡,如下图: 需要从 https://ftp.nc ...

响应生信技能树的号召:lncRNA数据分析传送门 , 一起来一个lncRNA数据分析实战! 下载原始测序数据: 在GEO数据库搜索GSE87182, 这里没有直接给出ftp地址,需要先从BioProj ...

一.配置目录可以是C盘用户目录下的.condarc channels: - https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/pkgs/free/ - ...

很多人都说传统的bulk转录组测序"廉颇老矣",急急忙忙转向了单细胞转录组这样的热点技术. 诚然,单细胞CNS好文层出不穷,不过最近无意中看到了一个传统的bulk转录组测序的sci ...

为进一步提高<微生物组实验手册>稿件质量,本项目新增大众评审环节.文章在通过同行评审后,采用公众号推送方式分享全文,任何人均可在线提交修改意见.公众号格式显示略有问题,建议电脑端点击文末阅 ...

关键词:零基础:叶绿体基因组:神器:国人佳作:一键成环. 软件官网:https://github.com/Kinggerm/GetOrganelle GetOrganelle 这款软件是建军和郁文彬老 ...

最近有粉丝在我们<生信技能树>公众号后台付费求助,想重新分析一下他自己领域的一个文章的转录组测序数据.因为那个文章并没有提供表达量矩阵,不过万幸的是人家上传了原始测序数据. 因为他的课题是 ...

生科云网址:https://www.bioincloud.tech 本文由微科盟phage根据实践经验而整理,希望对大家有帮助. 微科盟原创微文,欢迎转发转载,转载须注明来源<微生态>公众 ...

导言前几天看到基因课的东哥提了一下kingfisher,一个看起来就是极度便利的公共测序数据下载工具.我非常感兴趣,但也确实没时间折腾,于是继续丢给师弟去看看(事实上,他肯定也有类似需求....). ...

前面我带领大家通过IMGT数据库认知免疫组库,而且也一起从IMGT数据库下载免疫组库相关fasta序列,免疫组库重要的研究对象就是分成BCR的IGH,IGK,IGL这3类,以及TCR的TRA,TRB, ...

前面我带领大家通过IMGT数据库认知免疫组库,而且也一起从IMGT数据库下载免疫组库相关fasta序列,免疫组库重要的研究对象就是分成BCR的IGH,IGK,IGL这3类,以及TCR的TRA,TRB, ...

如果你的服务器在中国大陆,基本上就放弃prefetch啦,直接aspera即可.但是如果是在海外,就可以尝试比较prefetch和aspera下载速度. 需要注意的是:什么,SRA测序数据要收费了,同 ...

有关虚拟环境的相关的我之前也介绍过,python高级(4)-- 虚拟环境安装使用比如pipenv,还有virtualenv之类的,还有本篇文章的主角 -- poetry 到底哪个更好用呢,看你个人吧 ...

Linux系统方法一安装anaconda后,系统默认python环境是anaconda 默认创建的"root"/"base"环境,这是因为它把"启 ...

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