DNA甲基化测序数据处理(一):数据比对
相关推荐
-
什么是DNA甲基化?
近几年DNA甲基化经常被人提及,但很多人对它并不是很了解,那么到底什么是DNA甲基化,它又有什么作用呢,请看敬善基因为您介绍! DNA 化学修饰为 DNA 序列编码基因的表达增加了一层调控机制.这些化 ...
-
表观遗传学(Epigenetics)
表观遗传学的概念基于遗传学而来,不是单纯的体外在环境导致的甲基化和乙酰基化改变,也不是简单转录因子和miRNA等等基因调控,它的指的是由非DNA变异而改变表型的'可遗传的'现象.现在众多所谓的表观遗传 ...
-
单细胞甲基化测序(scBS-seq)比对率奇低?你的文库方向性参数可能没选对!
问题的提出 近年来单细胞测序真是火得一塌糊涂,易基因作为行业较早开展单细胞甲基化测序科研服务的企业,我们也接到了不少老师在数据分析方面的求助.在BS数据分析中,最常用的比对工具就是BSMAP和bism ...
-
定点甲基化修饰技术实验流程
甲基化是表观修饰的重要部分,DNA甲基化可以引起DNA构象.稳定性及DNA与蛋白质相互作用方式的改变,从而影响基因表达.DNA链中含有很多CpG结构,双链DNA CpG中的胞嘧啶五位碳原子通常容易被甲 ...
-
Illumina甲基化芯片是什么?Illumina甲基化芯片操作步骤
一.Illumina甲基化芯片 人类的许多疾病(包括癌症)是由于异常的甲基化引起的.Illumina甲基化芯片是一种DNA甲基化高通量筛选技术,精确到单个碱基的甲基化变化.单碱基分辨率实现了基因区域和 ...
-
DNA甲基化测序方法介绍
内容来自于 生信人社区 欢迎关注. DNA 甲基化是表观遗传学(Epigenetics)的重要组成部分,在维持正常细胞功能.遗传印记.胚胎发育以及人类肿瘤发生中起着重要作用,是目前新的研究热点之一. ...
-
易基因 | 常用的6种DNA甲基化测序方法,你知道几个?
什么是DNA甲基化? 简单来说,DNA甲基化就是在DNA甲基化转移酶(DNMT)的作用下将甲基选择性地添加到胞嘧啶上形成5′-甲基胞嘧啶的过程.DNA甲基化是最早发现的基因表观修饰方式之一,在维持正常 ...
-
Nature Biotechnology | Broad研究所开发新型DNA甲基化靶向测序技术,助力...
背景介绍 DNA甲基化是染色质表观遗传修饰的一种重要形式.DNA甲基化能够影响多种基因表达过程,并且可受到复杂的调控来指导复杂的生物学过程,如胚胎发生.衰老和肿瘤发生等.在人类基因组中,90%以上的C ...
-
精准医学: 应用脑脊液游离DNA全基因组甲基化测序筛选小儿髓母细 胞瘤早期诊断与预后监测的可靠生物标志物|液体活检专题
易点评 本文是液体活检DNA甲基化标志物发现的典型研究案例.儿童脑恶性肿瘤如髓母细胞瘤(MB)致癌基因突变频率较低,但DNA甲基化改变明显,根据MB的这一特点作者使用了WGBS和CMS-IP-seq技 ...
-
全基因DNA甲基化检测“金标准”--- 改进版简化基因组甲基化测序
亚硫酸盐转化被誉为DNA甲基化(5mC)检测的"金标准",非甲基化胞嘧啶C在亚硫酸盐转化过程中转变为尿嘧啶U,进而通过PCR扩增转变为胸腺嘧啶T,甲基化mC维持不变,通过高通量测序 ...
-
易基因 | 文献速递:重亚硫酸盐扩增子测序研究通过DNA甲基化监测急性髓系白血病MRD
大家好,这里是专注表观组学十余年,领跑多组学科研服务的易基因. 关于DNA甲基化测序方法,可以点击查看:常用的6种DNA甲基化测序方法,你知道几个? 今天要分享解读的是一篇发表于Leukemia(IF ...
-
综述科普:单细胞测序技术下的小鼠脑部DNA甲基化图谱
表观基因组的动态变化与哺乳动物大脑中的细胞分化和成熟有关,在调节神经元功能和动物行为方面具有重要作用.胞嘧啶DNA甲基化(5mC)是一种稳定的共价修饰,对基因调控至关重要.在哺乳动物基因组中,5mC主 ...
-
表观遗传调控衰老相关基因,警惕DNA甲基化引发过早衰老
表观遗传调控衰老相关基因,警惕DNA甲基化引发过早衰老 (衰老理论2-甲基化老化理论) 表观遗传学通常被定义为与基因组功能相关的改变,不涉及核苷酸序列的改变,如DNA甲基化或组蛋白修饰.据报道,表观遗 ...
-
背景:全基因组分析造血细胞中的DNA甲基化:WGBS的DNA甲基化分析
全基因组分析造血细胞中的DNA甲基化:WGBS的DNA甲基化分析 First Online: 23 July 2017 译者注意:文章感觉什么都没说,也就是讲一下背景,测序中的步骤,可以了解一下,中间 ...