单细胞甲基化测序（scBS-seq）比对率奇低？你的文库方向性参数可能没选对！ / 开普饭

导语环状RNA(circular RNAs, circRNA)是一类由 mRNA 前体经反向可变剪切而来的共价闭合且保守的单链转录本,长度跨度从几十bp到几千bp,在表观遗传及各种细胞过程中发挥重要 ...

开篇划重点: 不仅仅是--max_target_seq 1 有问题,-evalue 1e-5也有问题写在前面蹭热点,是一个获得流量,显得自己优秀的一个方式, 或许,写下这个博文,我也是在做这么一个 ...

. 数字生命健康产业创新服务基因慧 [导语]目前较常使用的DNA甲基化检测方法大都需要BS(重亚硫酸氢盐)处理,该技术容易导致绝大多数DNA分子发生断链.本文主要对甲基化文库构建过程中BS处理方案和 ...

m6A(N6-methyladenosine,6-甲基腺苷)是真核生物中最常见最丰富的RNA修饰,作为一种可逆修饰,RNA既可以在甲基化转移酶METTL3/14 等酶的作用下发生m6A甲基化修饰,又可 ...

单细胞及微量样本的DNA甲基化组学研究很大程度上受制于建库测序技术.传统的文库构建方法或类似于基因组DNA的单细胞扩增技术很难应用到甲基化实验过程中.易基因建立了基于线性扩增和单管建库的技术,可充分降 ...

前言因为组里面出了一批甲基化测序数据,使用的技术为BS-seq,处理的时候顺带记录了学习过程,演示使用数据为官方提供的example.fastq. DNA甲基化及CpG岛定义了解 DNA甲基化(英语 ...

内容来自于生信人社区欢迎关注. DNA 甲基化是表观遗传学(Epigenetics)的重要组成部分,在维持正常细胞功能.遗传印记.胚胎发育以及人类肿瘤发生中起着重要作用,是目前新的研究热点之一. ...

新课来袭 4月29日晚上19:30,张杜老师再次在易基因科技直播间为大家讲解如何利用甲基化测序发表SCI文章,和大家聊聊关于论文发表的那些事儿,并解答大家的种种疑惑,欢迎各位老师和同学前来切磋.交流. ...

编译:胡胡,编辑:景行.江舜尧. 原创微文,欢迎转发转载. 导读躯体感觉是由多种初级感觉神经元的存在定义的,这些神经元具有独特的生物学特征以及对外部和内部刺激的反应特征.然而,关于细胞状态的多样性是 ...

编译:阿温,编辑:景行.江舜尧. 原创微文,欢迎转发转载. 导读肺癌是导致癌症患者死亡的主要原因,它表现出的异质性使其具有适应性,限制了治疗的成功,且仍没有被完全了解.本研究采用30名转移性肺癌患者 ...

编译:夕夕,编辑:夏甘草.江舜尧. 原创微文,欢迎转发转载. 导读气孔谱系细胞发育的调控已被广泛研究.然而,基于单细胞转录组研究这一生物学过程还尚未报道.本文,作者主要对拟南芥5日龄的12844个单 ...

编译:小北,编辑:十九.江舜尧. 原创微文,欢迎转发转载. 导读目的:肿瘤的异质性是胃腺癌(GA)准确诊断和治疗的主要障碍.研究者在GA中利用单细胞RNA测序报道了系统的转录图谱来解释分子和细胞内的 ...

单细胞甲基化测序（scBS-seq）比对率奇低？你的文库方向性参数可能没选对！