SCENIC单细胞转录因子分析 / 开普饭

导语转录因子(Transcription factors)是一群能与基因特定序列专一性结合,从而保证目的基因以特定的强度在特定的时间与空间表达的蛋白质分子.转录因子通过识别特定的DNA序列来控制染色 ...

去年我们在<生信技能树>公众号带领大家一起学习过:SCENIC转录因子分析结果的解读 ,提到了在做单细胞转录因子分析,首选的工具就是SCENIC流程,其工作流程两次发表在nature系列杂 ...

五一劳动节,连续五天,在钉钉群直播互动授课带领大家系统性掌握cytoscape软件的使用方法和技巧,课程已经结束啦.文末有录播回放学习方式,以及配套授课资料! 下面是cytoscape讲师的笔记一. ...

编译:Sophie,编辑:十九.江舜尧. 原创微文,欢迎转发转载. 导读 Basic helix-loop-helix(bHLH)转录因子通过改变其靶基因的表达来调控多种生物学过程.然而,龙血树(Dr ...

去年我们在<生信技能树>公众号带领大家一起学习过:SCENIC转录因子分析结果的解读 ,而且前些天我给了一个单细胞转录因子分析之SCENIC流程:,但是单细胞各种交流群很多朋友反映自己f ...

一.转录因子介绍转录因子(Transcription factors)是一群能与基因特定序列专一性结合,从而保证目的基因以特定的强度在特定的时间与空间表达的蛋白质分子.转录因子通过识别特定的DNA序 ...

男, 一个长大了才会遇到的帅哥, 稳健,潇洒,大方,靠谱. 一段生信缘,一棵技能树, 一枚大型测序工厂的螺丝钉, 一个随机森林中提灯觅食的津门旅客. 使用AUCell识别单细胞rna数据中具有活性&q ...

放一张效果图,这些,三四年前的东西,我其实一直懒得说. 写在前面 "Gene Structure View (Advanced)"这个功能可以说,也是一时兴起写出来的.开发的主要动 ...

男, 一个长大了才会遇到的帅哥, 稳健,潇洒,大方,靠谱. 一段生信缘,一棵技能树. 生信技能树核心成员,单细胞天地特约撰稿人,简书创作者,单细胞数据科学家单细胞技术正在加强我们对细胞本身的理解.什 ...

写在前面今天我又更新了 TBtools.不过整体上是一些小的优化.并不值得长篇大论.当然,这主要是我"水"的能力还不够.正好出门在外,不想干活,那就看一下一些 paper.忽然想 ...

SCENIC单细胞转录因子分析