RNA芯片和测序技术的比较（学徒作业） / 开普饭

昨天我们GEO数据库的检索方式.但是对于里面的每一个数据集内容没有详细的解释,这次呢,我们就来介绍一下每个数据集里面包括哪些内容. 这次我们用GSE79973数据集进行介绍.(https://www. ...

之前在介绍GEO数据库数据分析的时候,我们介绍过GEO2R这个在线的分析GEO芯片数据的工具.但是对于GEO里面的一些二代测序的数据,就没办法进行分析了.最近新发布了一个在线的数据库eVITTA,则可 ...

欢迎来到医科研,这里是白介素2的读书笔记,跟我一起聊临床与科研的故事, 生物医学数据挖掘,R语言,TCGA.GEO数据挖掘. 这一节的内容包括应用 GEOquery包下载芯片数据,提取表达矩阵,提取m ...

#GEO是什么? GEO全称Gene Expression Omnibus data base,由美国国立生物技术信息中心NCBI创建并维护的基因表达数据库(通过NCBI首页,All Database ...

编译:夕夕,编辑:十九.江舜尧. 原创微文,欢迎转发转载. 导读 RNA测序(RNAseq)是生命科学领域最常用的技术之一,已广泛用于癌症研究,药物开发以及癌症诊断和预后.在各种生物学和技术问题的推动 ...

编译:东方不赢,编辑:Tracy.江舜尧. 原创微文,欢迎转发转载. 导读目前尚没有全面方法以单碱基分辨率鉴定单个转录物N6-甲基腺苷(m6A),但这对于估算m6A丰度又很重要,因此本文中研究者开发 ...

推荐:江舜尧编译:美少女编辑:马莉美国密西根大学Euisik Yoon等学者于2019年5月15日在期刊 <Nature Communications> 上发表了<Hydr ...

外泌体RNA测序背景简介外泌体(Exosome)是由包括肿瘤细胞在内的几乎所有类型的细胞都可以产生并释放的一种微囊,其内部包裹了DNA,RNA,蛋白等物质.众多的研究表明,外泌体在血液,乳汁,尿液等 ...

文献解读 Potter, S. S. (2018).Single-cell RNA sequencing for the study of development, physiology anddis ...

在一项新的研究中,来自美国麻省理工学院和哈佛医学院的研究人员利用一种新的组织扩张技术,设计了一种方法,对组织样本中的信使RNA(mRNA)分子进行标记,然后对mRNA进行测序.相关研究结果发表在202 ...

HBV是目前已知的感染人的最小DNA病毒,其基因组大小约为3.2 kb,包含4个高度重叠的开放阅读框(ORFs).除了这些经典的ORFs外,越来越多的证据表明,HBV还通过可变剪切形成了许多额外的OR ...

2021年国家自然科学基金结果出炉在即,首先预祝各位老师申请的本子都中标. 回顾过往十年,RNA甲基化修饰一直是国家自然科学基金表观遗传学研究的热门领域,其中m6A更是占据其中大半江山.那么究竟什么是 ...

RNA芯片和测序技术的比较（学徒作业）