GEO（Gene Expression Omnibus）：高通量基因表达数据库 / 开普饭

目录如下: 生信人必学ftp站点之NCBI-GEO 脚本作业-解读NCBI的ftp里面关于人的一些基因信息 NCBI的taxid简单介绍 NCBI的基因entrez ID相关文件介绍请直接看我博客吧 ...

最近在系统性总结类器官相关研究,发现2015发表在CELL杂志的-CRC-类器官研究里面居然还有单细胞数据,它不仅仅是类器官应用到肿瘤领域研究的早期代表作,而且也早于单细胞成为科研爆发热点期. 文章标 ...

解螺旋公众号·陪伴你科研的第2541天零代码复现非肿瘤文章大家好,我是濤濤.众所周知,仙桃生信工具www.xiantao.love一直致力于协助大家在进行生信研究提供便利性.最近,仙桃生信工具又推 ...

研究背景: 卵巢癌在全球与妇科癌症相关的死亡中排名第五.到目前为止,尚未完全了解卵巢癌的肿瘤发生和预后的分子机制.这项研究旨在发现参与卵巢癌的hub基因和治疗药物. 研究方法: 从Gene Expre ...

以GSE111229为例方法一 1 下载并保存GEO数据下载有error可以:设置镜像.翻墙.rm(list=ls())一下重试- library(GEOquery) GSE_name = 'G ...

从小白的角度,30分钟复现生信套路.今天为大家带来一篇2020年9月发表于International Journal of Chronic Obstructive Pulmonary Disease的 ...

最近还是大量粉丝留言表示自己因为疫情困在家里,想做数据挖掘混个本科毕业论文,但是看完我的GEO数据挖掘视频后,想下载个数据集,就被卡死了,实在是巧妇难为无米之炊! 这个不怪大家,我给大家的免费的GEO ...

A 什么是GEO数据库? GEO数据库全称Gene Expression Omnibus database,是由美国国立生物技术信息中心NCBI创建并维护的基因表达数据库.它创建于2000年,收录了世 ...

陈按:中国抗癌协会肿瘤靶向治疗专业委员会从结直肠癌NGS检测的临床角度及实验室流程质控角度共同起草了中国专家共识及标准,以指导NGS检测技术在结直肠癌诊疗中的规范应用,帮助临床医师解读报告,为结直肠癌 ...

北京讯近日,清华大学那洁课题组与剑桥大学的玛格达琳娜·泽尼卡·格兹(Magdalena Zernicka-Goetz)课题组合作,开发了一套基于机器学习的高内涵筛选策略,用以全自动分析和评估类胚 ...

去年,美国单细胞测序公司 10x Genomics 纳斯达克上市成功领跑,让单细胞测序再次亮相于聚光灯下. 什么是单细胞测序?简单来说就是单个细胞水平上对基因组进行测序.2013 年,Nature M ...

近年来,由于测序技术的发展,越来越多与疾病相关的基因得到确认,作为精准医疗的核心技术,测序已经应用于产前筛查.遗传病诊断.肿瘤诊断与治疗等方面,尤其在攻克肿瘤这一难题前,基因测序给肿瘤的预防和治疗提供 ...

北京4月27日电大面积阵列式纳米结构在光场调控.分子筛选组装.材料沉积等方面具有重要的作用,但是目前的制备技术尚无法同时满足高通量.结构一致.特征尺寸可调等核心目标.深入探究影响结构一致性的关键因素 ...

高通量基因编辑概述得益于高通量测序技术和生物信息学的发展,研究人员已经可以在较短时间内完成整个基因组测序工作.然而,如何快速高效的实现基因功能研究,仍然面临很大的挑战.传统基因功能的筛查方法主要通过 ...

近日,<临床肿瘤学杂志>发布了2021版<结直肠癌分子检测高通量测序中国专家共识>(以下简称"共识"), 该<共识>由中国抗癌协会靶向治疗专业委 ...

编译:卡德加,编辑:十九.江舜尧. 原创微文,欢迎转发转载. 导读传统的单细胞基因组测序方法在一致性和通量方面受到限制,本文研究者据此开发了一种结合组合索引(sci-)和线性扩增(L)的单细胞测序方 ...

GEO（Gene Expression Omnibus）：高通量基因表达数据库