sc-ATAC-seq细胞类型注释策略 / 开普饭

目前,人类基因研究已经揭示了与许多疾病风险相关的基因和基因位点.由于风险基因可能会影响任何细胞类型或组织中的任何细胞过程,这为确定可能的下游效应创造了巨大的探索空间.因此,我们亟需一种新的高通量方法来 ...

编译:罗睺,编辑:十九.江舜尧. 原创微文,欢迎转发转载. 导读单细胞RNA测序(scRNA-seq)是研究脑和中枢神经系统(CNS)中单个细胞转录组的一种有前途的方法.这项技术充当了神经科学,计算 ...

作为细胞异质性研究的重要工具,单细胞转录组测序技术近年来蓬勃发展,积累了大量研究数据.Cell BLAST是一个自带高质量参考数据库的scRNA-seq数据检索/注释工具.这个网站由北京大学的研究团队 ...

编译:小北,编辑:夏甘草.江舜尧. 原创微文,欢迎转发转载. 导读在哺乳动物胚胎形成过程中,差异基因逐步构建起每个组织和器官系统的命运和复杂性.在本文中研究者系统的定量了10.5天胚胎的发育到出生小 ...

编译:艾奥里亚,编辑:十九.江舜尧. 原创微文,欢迎转发转载. 导读近年来,随着单细胞RNA测序方法的规模和能力迅速扩大,这使得重大发现和大规模细胞测绘工作成为可能.但这些方法还没有得到系统和全面的 ...

导语今天和大家分享的是2020年1月份发表在SCIENTIFIC DATA杂志上的一篇文章(IF=5.929)"Single-cell RNA sequencing of human ki ...

男, 一个长大了才会遇到的帅哥, 稳健,潇洒,大方,靠谱. 一段生信缘,一棵技能树, 一枚大型测序工厂的螺丝钉, 一个随机森林中提灯觅食的津门旅客. 前言 Garnett是一个从单细胞表达数据中实现自 ...

本文来源于"复旦大学脑科学研究院" 哺乳动物的大脑由数目庞大.种类丰富的细胞所构成.不同细胞类型在分子.结构.功能等多个层面上彼此迥异,而这些差异往往是在神经发育过程中由精密的遗传 ...

编译:YQ,编辑:景行.江舜尧. 原创微文,欢迎转发转载. 导读植物根系对于生长发育至关重要,根系吸收养分和水,同时防御土壤微生物.在不断变化的环境压力下,根系进化出复杂的结构,包括不同功能的细胞类 ...

编译:稻和,编辑:景行.江舜尧. 原创微文,欢迎转发转载. 导读亨廷顿病(HD)是一种由Huntingtin(HTT)基因第1外显子的CAG三核苷酸重复扩增引起的致命神经退行性疾病.在HD中,突变的 ...

编译:Champion,编辑:夏甘草.江舜尧. 原创微文,欢迎转发转载. 导读本研究使用来自脐带和成人外周血的27种成熟细胞的90个RNA样品以及来自11种成熟细胞的32个小RNA样品进行分析.通过 ...

编译:不二,编辑:十九.江舜尧. 原创微文,欢迎转发转载. 美国哈佛大学干细胞和再生生物学研究所及哈佛医学院布拉瓦尼克研究所Paola Arlotta和Constance L. Cepko等人于201 ...

病毒工具使神经生物学家可以方便地实现细胞特异性地环路追踪和操控. 最近,艾伦脑科学研究所的Bosiljka Tasic团队在 Neuron 杂志在线发表了题为"Enhancer viruse ...

编辑:万仁涛:本文字数9874字,建议收藏阅读: 人类从森林走来. 300万年前,人类刚刚与动物界分离时,森林是人类最早的家园,"走出森林"是人类文明的第一个起点.如今为了寻找我们 ...

生物信息学数据库种类繁多,其中基因ID是很多人比较困惑的,尤其是很多产品居然还不是基因ID的问题,比如表达芯片是探针,所以我策划了一系列ID转换教程,见文末!我的包里面有一个函数大家比较感兴趣,就是为 ...

sc-ATAC-seq细胞类型注释策略