一条代码完成完成无限分组的微生物差异分析 / 开普饭

于2021年3月发表在CELL杂志的文章, 标题是:<In vivo CD8+ T cell CRISPR screening reveals control by Fli1 in infect ...

写在前面 CSV/TSV作为数据科学和组学分析的基本格式,其实本质上均为txt格式的表格,CSV是按逗号分隔,TSV是以制表符分隔的表格.这两种格式数据格式应用非常广泛.比较常用的处理软件包括: Ex ...

最近看到一个文献,是数据集:https://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE101668 GSM2711785 RKO-WT-rep1 ...

下面是MeRIP-seq 图表复现笔记上一期提到使用exomePeak2进行m6A的Peak Calling,结果如下,每个样本一个结果: ├── ADDInfo │ ├── ADDInfo_G ...

回顾单细胞RNA-seq分析介绍单细胞RNA-seq的设计和方法从原始数据到计数矩阵学习目标了解R言语使用的各种数据类型和数据结构在R中使用函数并了解如何获取有关参数的帮助使用dplyr ...

写在前面 ggClusterNet开发到现在,任然是有好多的网络分析方面的功能需要添加进入,例如sparcc网络计算过程: SparCC 对微生物组数据拟合狄利克雷分布,对微生物的比例及相关性计算迭代 ...

原文:深度分析mysql GROUP BY 与 ORDER BY.mysql取出每个分组中最新的记录.mysql 分组取最新的一条记录(整条记录) 1.建表.插入测试数据 CREATE TABLE ` ...

本文英文版的作者为 Bernd Leukert,SAP SE 产品与创新执行委员会成员(Member of the Executive Board, SAP SE Products & Inn ...

IE浏览器是Windows系统内置的浏览器,不过越来越多的使用者在新装系统之后,通常会选择重新下载第三方的浏览器进行使用,然后再把电脑桌面上的IE浏览器图标删掉.可是我们在对IE浏览器图标进行鼠标右键 ...

写在前面今年的毕业生应该是6月底离校,但是这位朋友到了九月份终于完善了手上的工作,对这几年来了一个完善的结束,感谢送给我的一方印章,也祝铠鸣大展宏图.再有就是ggclusterNet功能也完善了90 ...

本次更新去除对microbiomeSeq的依赖: 因为这个包目前在github上,bioconductor上的不好用. 写在前面网络整体属性 - 平均度(Average degree)和平均加权度 ...

写在前面之前我看到microbiomeSeq编写了这些函数,同时将zipi plot做的更加精细一些,但是代码实在是太难用了,尤其是包冲突事件实在是太多,所以我不得已将他的函数做了修改,并放到ggC ...

写在前面回归,是我们经常用到的分析手段,对于结果的确定比差异分析和相关分析都要更加深入,所以无论是大小文章,都可以看到回归的影子. 今天我来带大家,仅仅需要一条代码,就将这个分析做的透明,透彻,审稿 ...

写在前面 2020年2月19日,疫情还在继续,相信持续不了多久了.还在假期中,但还是可以持续发光发热的.今天我为大家带来词云,词云这种出图方式实际上再各个领域都有比较广发的引用,尤其是引文分析,广告等 ...

一条代码完成完成无限分组的微生物差异分析