GEO在线分析工具 / 开普饭

GEO虽是一个宝库,但是使用GEO进行数据分析可不是一件简单的事! 首先,GEO的数据检索非常不方便,例如,我想获取有预后信息的乳腺癌数据,显然使用GEO官方检索起来很难. 其次,GEO大部分数据都基 ...

解螺旋公众号·陪伴你科研的第2526天零代码复现二区期刊本次给大家零代码复现一篇2021年发表于Gland Surgery的中科院二区期刊,影响因子2.19分. 文章题目 Identificati ...

有学员提出来了一个问题,就是可以比较同样实验设计的表达量探索研究,一个研究使用的是芯片,一个是测序,看看两者的差异基因情况的overlap情况.其实这样的例子非常多,比如下面这样的展现方式: 下面给大 ...

研究背景: 卵巢癌在全球与妇科癌症相关的死亡中排名第五.到目前为止,尚未完全了解卵巢癌的肿瘤发生和预后的分子机制.这项研究旨在发现参与卵巢癌的hub基因和治疗药物. 研究方法: 从Gene Expre ...

解螺旋公众号·陪伴你科研的第2541天零代码复现非肿瘤文章大家好,我是濤濤.众所周知,仙桃生信工具www.xiantao.love一直致力于协助大家在进行生信研究提供便利性.最近,仙桃生信工具又推 ...

之前在介绍GEO数据库数据分析的时候,我们介绍过GEO2R这个在线的分析GEO芯片数据的工具.但是对于GEO里面的一些二代测序的数据,就没办法进行分析了.最近新发布了一个在线的数据库eVITTA,则可 ...

昨天我们GEO数据库的检索方式.但是对于里面的每一个数据集内容没有详细的解释,这次呢,我们就来介绍一下每个数据集里面包括哪些内容. 这次我们用GSE79973数据集进行介绍.(https://www. ...

目前富集分析工具多种各样包括在线工具与R包等,富集到的结果以及分析的库也各不相同,昨天我在生信技能树介绍了:从基因名到GO注释一步到位,里面提到了其实有3个常见的网页工具也可以做到同样的分析,代码并没 ...

随着高通量测序技术种类的越来越多,我们经常会拿到相关样本的不同组学的数据.那拿 TCGA 的数据库而言,对于同一个患者,就检测了RNA-seq, miRNA-seq, 甲基化芯片等等多组学的数据.对于 ...

GEO数据库全称GENE EXPRESSION OMNIBUS,是由美国国立生物技术信息中心NCBI创建并维护的基因表达数据库.它创建于2000年,收录了世界各国研究机构提交的高通量基因表达数据,也就 ...

我经常说瑜伽是一个工具; 其实如果要把瑜伽比喻为一个工具,可能我首先会想到的是镜子.... 瑜伽练习是生活的一面镜子:它映照着你的情绪,你的情感,你的疑虑和你的期望.在练习中观察自己,就像照镜子一样, ...

内容来源:本文为六人行图书出品书籍<培养你的逻辑脑>书摘,作者为宋欣桐,笔记侠作为合作方,经出版社审核授权发布. 作者简介:宋欣桐,个人发展学会专家合伙人,工商管理硕士,知名考研辅导机构一 ...

<觅新>是金色财经推出的一档区块链项目观察类项目,覆盖行业各领域项目发展情况,具体设计到项目概况.技术进展.募资情况等,力图为您呈现热门新潮的项目合辑. 风险提示:"金色财经·觅 ...

最近,我因为工作原因,需要绘制一份公司管理业务的流程图,但个人是刚踏出校园的大学生,在画流程图方面并没有多少经验,因此有点发愁.不过好在我所在办公室部门有一些乐于助人的同事,他们推荐了一个好方法给我, ...

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