表达矩阵数据分析免疫环境组成分析可以是标配 / 开普饭

与常规的RNA-Seq一样,10x单细胞RNA-Seq/ST-Seq也需要测序数据比对到参考基因组进行基因的定量.那么参考基因组的质量就对单细胞的分析结果有着重大的影响. 接下来小编就给大家介绍一下1 ...

表达谱数据分析的时候,经常包括各种各样的分析.比如差异表达分析,富集分析,GSEA,蛋白相互作用分析等等等等.NetwordAnalyst(https://www.networkanalyst.ca/ ...

以第一个基因为例,根据group_list来检验在分组之间是否存在差异 load(file='step1-output.RData') dat[1:4,1:4] table(group_list) # ...

我们阅读量破万的综述:RNA-seq这十年(3万字长文综述) 给粉丝朋友们带来了很多理解上的挑战,所以我们开辟专栏慢慢介绍其中的一些概念性的问题,上一期: 箱线图的生物学含义这一讲我们来说一下lim ...

featureCounts我们粉丝都耳熟能详了,我们转录组流程介绍的对比对后的bam文件基于基因注释文件定量的首选软件,用法非常简单,关键是速度飞快,吊打htseq-counts几条街,而用DEXSe ...

如果我们最后拿到的是蛋白编码基因,当然可以很容易的注释到各种数据库,比如:Gene Ontology terms, KEGG, Reactome, NetPath, PID, INOH and Bio ...

学徒和学员已经陆续出师,是时候把生信技能树的舞台交给后辈了! 下面是学徒写的<GEO数据挖掘课程>的配套笔记(第3篇) B站课程<三阴性乳腺癌表达矩阵探索>笔记之文献解读三阴 ...

有一些五六年前的学生们都成长为了各个生物信息学相关公司的小领导,而且他们都有了自己的公众号,知乎号,也算是一番人物.最近他们跟我反馈面试找不到或者说很难直接考核筛选到认真干活的生信工程师,挺有意思的. ...

作为一名数据分析师,你又没有发现,自己经常碰到一些棘手的问题就没有思路,甚至怀疑自己究竟有没有好好学过分析? 譬如:KPI又出现较大波动,待会领导估计要问起来,赶紧分析数据找原因:再比如,新上线某个产 ...

作为一名数据分析师,你又没有发现,自己经常碰到一些棘手的问题就没有思路,甚至怀疑自己究竟有没有好好学过分析? 在上篇文章里,我们讲到了数据分析中的流程.分类.对比三大块,今天,我们继续讲剩下的3块内容 ...

✔️ 在昨天公布的「理论卷」中,被大家投票出来目前稳居榜首第一的就是「何为赛博社会?请结合实例谈谈当前媒介生态环境(30分)」. 其实大概也能猜到,任何和技术沾边的内容都既然能够成为试卷当中的重要考察 ...

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