这款全能型的肿瘤挖掘工具更新了，加速课题进展 / 开普饭

Lung metastases share common immune features regardless of primary tumor origin 肺转移瘤具有共同的免疫特征,无论其原发肿 ...

<道德经>"玄之又玄,众妙之门" gsea和gsva算法大家应该是都很熟悉了,我也多次讲解: GSEA分析一文就够(单机版+R语言版) GSEA的统计学原理试讲 GSV ...

与此同时,不少粉丝对GSVA或者ssGSEA分析方法提出了要求,变相催稿.其实GSVA或者ssGSEA是有成熟的工具,我暂时没有找到它们的卖点.不过,我注意到了一个GitHub包,ncborcherd ...

工具入口:www.chrislifescience.club:3838/R/AnnoE2 为何要求解"A基因通过B通路调控C疾病的D功能"这个公式? 1.这个是一个课题的万能公式, ...

TCGA转录组数据在完成差异分析后,我们通常希望系统地获取这些成百上千的差异基因的功能信息,帮助我们分析下游实验的思路.面对大量的差异基因,逐个查询基因功能是不切实际的.所以我们需要借助基因功能富集分 ...

(现在学习量和弹幕都非常少,大家的机会来了哦!) https://www.bilibili.com/video/av81874183 前奏最近做的生存分析都是奇奇怪怪的,从来没有重复出作者的图.哈哈 ...

大家应该对通路富集分析都很熟悉,如DAVID.超几何富集分析等.都是在大量文章中常见的通路富集方法,给大家介绍一个更加复杂的通路富集分析的前期数据处理包GSVA(gene set variation ...

学徒和学员已经陆续出师,是时候把生信技能树的舞台交给后辈了! 下面是学徒写的<GEO数据挖掘课程>的配套笔记(第6篇) 文献解读数据下载及理解差异性分析差异基因的富集分析 TNBC定 ...

关于免疫浸润分析,可谓是最近一段时间的热点,很多文章基于肿瘤免疫细胞微环境进行分析,不管是进行下游基因筛选也好,还是构建诊断模型也好,发表了很多相关的研究.在前面关于<CIBERSORT在免疫浸 ...

导语今天和大家分享的是2019年11月发表在Frontiers in Genetics杂志(IF=3.517)上的一篇文章,"Identifying Key Genes and Funct ...

编译:夕夕,编辑:十九.江舜尧. 原创微文,欢迎转发转载. 导读差异表达分析(DE)和基因富集分析(GSE)常用于单细胞转录组研究中.本研究中,作者开发了一种集成且可扩展的方法--iDEA,可通过分 ...

GSEA 相信看过我生信菜鸟团博客的朋友都已经耳熟能详了的,其需要样本的描述以及分组信息,来计算每个基因的差异度量对它们进行排序,然后走GSEA. 虽然有ssGSEA这样的单样本的分析,但仍然不够,也 ...

2020年非肿瘤的免疫浸润肯定是一个大热门!还没有做的小伙伴就参考着这篇文章可以开始设计自己的课题了. Elucidating the molecular pathways and immune sy ...

这款全能型的肿瘤挖掘工具更新了，加速课题进展