Pubmeth：癌症相关甲基化数据库 / 开普饭

不知不觉在单细胞转录组领域做知识分析也快两年了,很幸运聚集了五个小伙伴携手共进,我们承诺不间断更新5个月,把我们这两年的学习成果全部掏出来给大家,包括5个栏目: 文献速递(简短介绍,扩充知识面) 文献 ...

真正做生信工具(R包,软件,网页)的很少,但是需要用工具的却超级多,比如:GEPIA2详解(中国智造-肿瘤数据库),主要是看表达量和生存,引用就是(1659+130),再比如GDCRNATools这个 ...

MethylMix: an R package for identifying DNA methylation-driven genes. 本文参考:识别甲基化驱动的癌症基因 GetData函数,怎么 ...

之前我们介绍过一些用来预测基因在肿瘤当中表达情况的数据库.例如,GEPIA.UALCAN这些的.这些的数据库主要是通过输入目标基因,同时点击想要进行分析的模块就可以返回相关的结果.如果厌倦了点点点的话 ...

导语癌症被列为所有人类疾病中最致命的杀手之一.研究表观遗传修饰的改变模式,最重要的是是弄清DNA甲基化事件如何调节癌基因激活,肿瘤抑制基因沉默和染色体不稳定性,在肿瘤发生中起关键作用. 人类DNA甲 ...

m6A是mRNA上最丰富的甲基化修饰,是RNA中腺嘌呤(A)上第6位N原子上的甲基,主要存在于mRNA的CDS区和3'UTR区,影响mRNA的稳定性,翻译效率,可变剪接和定位等.此外,长非编码RNA以 ...

当我们拿到一个基因,常规分析它的高低表达及功能后,还能从哪方面入手呢?大家都知道DNA甲基化修饰在人类疾病中发挥重要作用,尤其影响癌的发生发展,所以我们可以来探讨一下目的基因的甲基化情况.之前的推荐的 ...

世界卫生组织调查发现,1/3的癌症可以预防,1/3的可以早发现.经及时治疗可治愈,而只有1/3的癌症不能治愈. 但一些癌症早期症状具有很强迷惑性,有些甚至会被误认为其他小病,从而耽误治疗,抱憾终生. ...

老刘67岁,参加工作后就爱上了喝茶,也喜欢研究茶文化.他看过许多关于茶的文章,都说喝茶有好处,可以降血压.防癌等,所以退休后也保持每天沏茶的习惯. "喝茶防病"的观念深入人心,有的 ...

编译:阿温,编辑:谢衣.江舜尧. 原创微文,欢迎转发转载. 导读癌症相关成纤维细胞(CAFs)与结直肠癌(CRC)细胞之间的代谢相互作用在CRC发展中起着重要作用.然而,关于脂质在CAFs中的变化以 ...

晚期肿瘤常常会出现影响生活质量的一些症状,如疼痛.食欲减退.恶病质.焦虑.便秘.谵妄.抑郁.腹泻.呼吸困难.乏力.呃逆.失眠.口腔问题.恶心.呕吐.多汗.终末期烦乱不安.终末期呼吸问题等等,妥善处理是 ...

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