MethyCancer：癌症相关甲基化基因数据库 / 开普饭

专注生物分析最前沿定期解读生信文章提供生信分析思路和套路方便大家短平快发SCI 关于甲基化方面的探索,传统的方法无非是现在公共数据库中下载数据,差异分析构建模型,外部数据验证或者与靶基因相关性分 ...

"Pan-Cancer Analysis of HumanKinome Gene Expression and Promoter DNA Methylation Identifies Dar ...

近几年DNA甲基化经常被人提及,但很多人对它并不是很了解,那么到底什么是DNA甲基化,它又有什么作用呢,请看敬善基因为您介绍! DNA 化学修饰为 DNA 序列编码基因的表达增加了一层调控机制.这些化 ...

表观遗传学的概念基于遗传学而来,不是单纯的体外在环境导致的甲基化和乙酰基化改变,也不是简单转录因子和miRNA等等基因调控,它的指的是由非DNA变异而改变表型的'可遗传的'现象.现在众多所谓的表观遗传 ...

甲基化是表观修饰的重要部分,DNA甲基化可以引起DNA构象.稳定性及DNA与蛋白质相互作用方式的改变,从而影响基因表达.DNA链中含有很多CpG结构,双链DNA CpG中的胞嘧啶五位碳原子通常容易被甲 ...

谢京合关注 0.5022020.10.28 17:56:10字数 844阅读 600 我的天,第一次接触甲基化数据,真是令人头大. 那就先从TCGA上下载某一种癌症的甲基化数据开始吧. 1.下载. 数 ...

大家好,今天要和大家分享的是2021年6月发表的一篇文章:"Pan-cancer methylation analysis reveals aninverse correlation of ...

研究过程中,也许有一个问题曾经困扰过你:"该基因是否已经在文献中描述为甲基化且属于哪种癌症类型".虽然不难回答,但解决此类问题比较耗时,一般通过文本挖掘方法(GoldMine)可以 ...

当我们拿到一个基因,常规分析它的高低表达及功能后,还能从哪方面入手呢?大家都知道DNA甲基化修饰在人类疾病中发挥重要作用,尤其影响癌的发生发展,所以我们可以来探讨一下目的基因的甲基化情况.之前的推荐的 ...

越来越多的证据表明,夜班工作者中癌症更为普遍,这也促使了世界卫生组织(WHO)国际癌症研究机构在2019年将夜班工作归类为"可能对人类致癌". 但夜班工作究竟为何会增加癌症风险,现 ...

长期更新列表: 使用R语言的cgdsr包获取TCGA数据(cBioPortal)TCGA的28篇教程- 使用R语言的RTCGA包获取TCGA数据 (离线打包版本)TCGA的28篇教程- 使用R语言的R ...

为了分析不同类型.组织起源肿瘤的共性.差异以及新课题.TCGA于2012年10月26日-27日在圣克鲁兹,加州举行的会议中发起了泛癌计划.参考:https://www.ncbi.nlm.nih.gov ...

m6A是mRNA上最丰富的甲基化修饰,是RNA中腺嘌呤(A)上第6位N原子上的甲基,主要存在于mRNA的CDS区和3'UTR区,影响mRNA的稳定性,翻译效率,可变剪接和定位等.此外,长非编码RNA以 ...

我们人体的基因表达情况是会随着年龄的变化发生变化的.通过了解正常人当中那些基因随着年龄会发生变化,对于研究和年龄有关的疾病也有种重要的作用.今天就来介绍一个年龄有关基因表达数据库:ADEIP (htt ...

2014年人类全基因组测序成本降低至1000美元,全球基因检测领域迎来了第一个春天,中国的基因检测市场更是爆炸式增长.2017年,Illumina再次将全基因组测序成本降低到800美元.测序成本降低的 ...

世界卫生组织调查发现,1/3的癌症可以预防,1/3的可以早发现.经及时治疗可治愈,而只有1/3的癌症不能治愈. 但一些癌症早期症状具有很强迷惑性,有些甚至会被误认为其他小病,从而耽误治疗,抱憾终生. ...

MethyCancer：癌症相关甲基化基因数据库