SNP调控选择性多聚腺苷酸化数据库 / 开普饭

lncRNA中的SNP及其对lncRNA的影响怎么做?疾病中lncRNA的表达是什么? 这样的小问题,LncRNASNP大可爱都能解决. lncRNASNP的构建图 IncRNASNP 是提供人.小鼠 ...

本期直播主题:做网红医生有前途吗?教你打造自己的个人IP! 点击预约按钮,领开播好礼! 解螺旋公众号·陪伴你科研的第2670天你想了解的数据库我们之前在介绍肿瘤表观遗传相关数据库MR4Cancer ...

该数据是我自己下载整理过的数据. 下载日期:2021年7月12日下载方式:TCGAbiolinks包数据类型:RData 变量名称:expDataTPM > ##加载数据,数据对象是一个数据 ...

昨天介绍的TC3A是基于TCGA肿瘤数据来进行分析的,而这次的这个APA atlas (https://hanlab.uth.edu/apa/)则是基于GTEx的数据来分析的.如果不清楚TCGA和GT ...

既往众多的大规全基因组关联研究(GWAS)在人类基因组上发现了 269 个与前列腺癌发病风险密切相关的风险区域,其中包含了大量单核苷酸多态性 (SNP) 位点,但是其中约 98% 的 SNP 位点位于 ...

肿瘤浸润免疫细胞作为肿瘤微环境的组成部分,影响肿瘤的进展.预后及治疗.其中遗传变异被认为是影响免疫反应的关键因素.因此,鉴定免疫数量性状位点(immunQTL)以评估遗传变异对免疫细胞浸润的影响,可能 ...

系列帖的由来最近一直是在总结核酸研究杂志2019发表的数据库(关于这个他们杂志专门发了一个总结文献,感兴趣的可以去看看,PMID: 31906604,如果懒得自己看,可以每天看一下我们公众号就行), ...

一个文章套路的小故事 TCGA原始的数据库只有表达组学.甲基化.临床信息这些数据,所以大家在挖掘数据,最基本的就是在这几个组学里面来回的交叉融合.如果一个癌种别人交叉分析了,那其实基于基础的思路很难再 ...

单核苷酸多态性(SNP)的变化,可以影响基因的的调控.如果这个SNP又正好位于lncRNA上,那么就是这个SNP可能调控lncRNA的功能了. lncRNASNP2(http://bioinfo.li ...

前mRNAs的选择性剪接可通过与无义介导的mRNA衰变(NMD)偶联来调节基因表达水平. 为了阐明选择性剪接结合NMD(AS-NMD)调控的一系列mRNAs,我们对秀丽隐杆线虫NMD缺陷突变株的pol ...

一.转录因子介绍转录因子(Transcription factors)是一群能与基因特定序列专一性结合,从而保证目的基因以特定的强度在特定的时间与空间表达的蛋白质分子.转录因子通过识别特定的DNA序 ...

转录调控网络(TRN)的重建是人类遗传学中的长期挑战.已经开发出许多计算方法来从高通量数据推断人类转录因子(TF)和靶基因之间的调控相互作用,TRRUST是迄今为止,最大的可公开免费获得的人类TF-靶 ...

SNP调控选择性多聚腺苷酸化数据库