生信新思路：选择性多聚腺苷酸化系列帖介绍 / 开普饭

欢迎来到医科研,这里是白介素2的读书笔记,跟我一起聊临床与科研的故事, 生物医学数据挖掘,R语言,TCGA.GEO数据挖掘. 前言此前笔者在小张聊科研.生信人.百味科研芝士.丁香园的科研论文时间等公 ...

为了分析不同类型.组织起源肿瘤的共性.差异以及新课题.TCGA于2012年10月26日-27日在圣克鲁兹,加州举行的会议中发起了泛癌计划.参考:https://www.ncbi.nlm.nih.gov ...

MA Anderson御用软件SpliceSeq已经是发表于2012的文章了:<SpliceSeq: a resource for analysis and visualization of R ...

昨天介绍的TC3A是基于TCGA肿瘤数据来进行分析的,而这次的这个APA atlas (https://hanlab.uth.edu/apa/)则是基于GTEx的数据来分析的.如果不清楚TCGA和GT ...

前几天一直在和大家分享一些关于3'UTR以及3'UTR当中的APA(Alternative Polyadenylation, 选择性多聚腺苷酸化)的内容,为什么要花这么久的时间分享这些呢?主要还是看到 ...

前几天一直在和大家分享一些关于3'UTR以及3'UTR当中的APA(Alternative Polyadenylation)的东西,为什么要花这么久的时间分享这些呢?主要还是看到了两篇利用 TCGA ...

发现我们常见的生信发文热点有免疫评分.m6A.铁死亡等等,例如下面这三篇经典的范文: 1.Identification of Key Genes inThyroid Cancer Microenvir ...

融合基因是由染色体重排而产生的,包括染色体的易位,插入,颠倒,缺失. 基因融合也在肿瘤发生发展过程起重大作用,约2成的癌症患者死亡是因为有基因融合这样的突变.基因融合广泛发生在各种各样的的癌症,而且很 ...

一个文章套路的小故事 TCGA原始的数据库只有表达组学.甲基化.临床信息这些数据,所以大家在挖掘数据,最基本的就是在这几个组学里面来回的交叉融合.如果一个癌种别人交叉分析了,那其实基于基础的思路很难再 ...

写在前面在"肉眼可见"的范围内,与生信靠得上边的公众号却一个劲儿地推送"界面化操作软件"的,可能就我一个.毕竟我暂时还没有我觉得拿得出手的东西来分享.可能是因 ...

人人向往的生信文章究竟是怎么做出来的?生信小白如何从零起步,读懂生信图.做出漂亮的生信图片?SCI生信文章复现系列为你打开新世界大门,带你逐一复现生信SCI全文图片,手把手教你发生信SCI!本节将为大 ...

生信新思路：选择性多聚腺苷酸化系列帖介绍