【温故知新】小麦育种KASP标记标记库及高通量检测平台

小麦KASP分子标记库小麦是世界上最重要的粮食作物之一。小麦的基因组比较大且复杂，如何开发SNP标记，借助分子标记辅助选择育种技术(MAS)来加快小麦新品种选育面临着非常大的挑战。LGC可以为广大的小麦育种家提供完整的高通量基因分型解决方案，包括植物样品收集，DNA提取及基因分型服务，以及建立高通量分子检测平台。在分子育种中，建立覆盖面全且精准的功能分子标记库是分子辅助育种的关键。LGC联合英国布里斯托尔大学(University of Bristol, UK)，综合育种平台(IBP)和中国农科院作物科学研究所小麦品质育种团队开发三套经过验证的功能标记库。不像芯片系统预制固定位点，小麦基因分型KASP标记库可以灵活选择定制，方便灵活运用于不同的育种和检测项目。此外KASP基因分型实验具有很高的经济性，因此可以在您的育种项目中提供一种贯穿项目始终的经济实用的SNP检测方案。＊布里斯托尔小麦基因组标记库：该标记库是联合英国布里斯托尔大学生命科学学院开发的一套包含7000个已经验证的KASP标记库。关于该项目的更多信息，请进入布里斯托尔小麦基因组学网站，访问谷物专栏。布里斯托尔小麦分子标记库的开发可以参考以下文章：CerealsDB 2.0: an integrated resource for plant breeders and scientists.Wilkinson, P.A., Winfield, M.O., Barker, G.L.A., Allen, A.M., Burridge, A, Coghill, J.A., Burridge, A. and Edwards, K.J. (2012), BMC Bioinformatics 13: 219.＊小麦KASP分子标记核心库：在布里斯托尔小麦库中，选出960个已经验证过的标记，它们以10 cM的间隔均匀地分布在整个小麦A、B和D基因组中。960个均匀分布的标记可以达到中等分辨率的扫描精度，例如，用于亲本品种鉴定和开发培育新品种。选择标记:小麦分子标记库覆盖A，B，D基因组，以及这些基因组的所有染色体。为了方便您查找感兴趣的标记，我们开发了一个在线搜索工具，你可以输入SNP ID，染色体或者位置进行搜索。此外，您也可以分别下载A， B，D基因组上标记。IBP小麦标记库:起初，全球挑战计划（The Generation Challenge Programme）开发IBP小麦标记库，促使不同环境中小麦种质资源的的发展，既是是在非生物胁迫对产量产生显著的影响的情况下。

优势：标记库包含8000个已验证可以成功分型的SNP标记；前所未有的低成本及强大的KASP技术；根据基因组上的位置，灵活定制选择项目所需的标记；方便快捷——在育种群体或新品种上可以直接使用大量的标记；没有最小订购量的限制——直接订购选好的标记；可以选择在自己实验室做或者交由LGC做基因分型服务；＊中国农科院作物科学研究所小麦品质育种团队率先基于国内育种家材料开发一套KASP功能标记库：中国农科院作物科学研究所小麦品质育种团队利用作物基因组序列信息和先进的分子生物学技术，定位克隆小麦基因，并开发育种可用的分子标记，建立高效的分子标记辅助选择技术体系；创制优良小麦亲本，培育高产优质多抗小麦新品种，促进我国小麦产业发展和生产能力提升。他们分两次检测，从156个标记中去除34个标记没有多态性或质量较差的标记，最终成功开发出122对标记，对应76个功能基因的情况简述如下：适应性相关基因（标记1～13）；籽粒大小、千粒重相关基因（标记14～25）;抗穗发芽相关基因（标记26～29）;高分子量谷蛋白亚基HMW-GS（标记30~33);低分子量谷蛋白亚基LMW-GS（标记34～35）;其它品质相关基因（标记36～53);抗旱等相关基因（标记54～62）;抗病虫基因（标记63～76）;

小麦育种KASP标记高通量检测平台何中虎创新团队平台特点

检测快速：3天完成1500份材料的122个标记信息；准确性高：标定基因特异序列，目标明确；结果稳定：荧光检测，减少误差，重复性好；价格低廉：微量试剂检测，成本降低60%；122个目标性状基因明细分类性状位点数产量矮杆、粒重、籽粒性状等19品质高低分子量亚基、硬度、面包体积、面团色泽等39适应性光周期、春化等21抗逆抗旱、茎秆糖、穗发芽等21抗病虫抗赤霉、条锈、叶锈、秆锈、白粉病等22分子育种流程1准备亲本/种质资源2KASP检测明确基因型3组合配制育种目标4分离世代单株选择5叶片DNA提取6KASP分型7保留目标基因单株8品系目标性状评价与基因确认9新品种研究历程：

1999年至今重要性状基因发掘

2003年至今基因标记开发验证

2013年至今KASP标记转化与验证

2016年50K/15K育种芯片研制

Dx5、By8、Ppo18等品质标记辅助培育新品种

中国农科院作物科学研究所小麦品质育种团队