为什么是AUC值而不是GSEA来挑选转录因子呢 / 开普饭

写在前面今天我又更新了 TBtools.不过整体上是一些小的优化.并不值得长篇大论.当然,这主要是我"水"的能力还不够.正好出门在外,不想干活,那就看一下一些 paper.忽然想 ...

在GSEA分析中,在MSigDB(Molecular Signatures Database)数据库中定义了很多基因集,下载的基因集是gmt格式文件.下载的gmt格式文件,打开后可以看见是下面这个样子 ...

测序上游分析系列: mRNA-seq转录组二代测序从raw reads到表达矩阵:上中游分析pipeline miRNA-seq小RNA高通量测序pipeline:从raw reads,鉴定已知miR ...

TCGA转录组数据在完成差异分析后,我们通常希望系统地获取这些成百上千的差异基因的功能信息,帮助我们分析下游实验的思路.面对大量的差异基因,逐个查询基因功能是不切实际的.所以我们需要借助基因功能富集分 ...

先看看MSigDB中的基因ENTREZID是否可以全部转化为SYMBOL. library(biomaRt)library(clusterProfiler)library(org.Hs.eg.db)l ...

** R语言绘制ROC曲线在临床医学中的应用 ** #计算体脂率对诊断妊娠期糖尿病的ROC曲线.截断值 sumExcel1.2018合4_列合并症<- read.csv("C:\Use ...

最近在整理表观相关技术文献,包括各种甲基化芯片技术,27k,450k,850k,以及甲基化测序的 WGBS和RRBS其实它们应用,最后也是构建各种模型,比如分子分型啊,细胞比例他推断啊,分类模型或者预 ...

文 | 杨帆微信号 | eautocar 2018年是中国改革开放40周年,也是产业变革期.市场变革期.政策变革期"三期叠加"的历史关口.恰恰是在这关键时期,受制于中美贸 ...

投资者在炒股的时候,一定要有准确风险意识.这样投资者才可以抓住机会,规避风险.其实对于企业的风险评估方法还是有少的.下面我就来说说信用评分模型里面的股票z指数分析法. 股票z值略低什么意思? 股票Z值 ...

目前在市场中有一个很不错的车,它就是宝沃汽车旗下的车型-宝沃bx5.产品力突出,性能优异,并且在外观.内饰.空间等方面都很出色.这些各种各样的优点,使得宝沃汽车受到广大用户的认可. 入手宝沃bx5有半 ...

有形只能说明你的存在而存在本身并不决定价值决定价值的是与存在相对应的虚无绕晕了?举个栗子! 就像茶杯不管它什么造型.外观如何杯体的存在并不是杯子的真正价值真正的价值是里面虚无没有这个虚无 ...

古云:"气有余便是火,气不足便是寒",是有道理的. 但是,往往有些患者气不足而虚火上浮,前贤李东垣认为此属阴火,常用补中益气之品加黄连少许,且参.芪用量很轻,其中即有补气防虚火上浮 ...

为什么是AUC值而不是GSEA来挑选转录因子呢