单细胞转录组10X数据处理视频课程上游流程代码
相关推荐
-
踩坑日志 | kingfisher 公共测序数据 SRA/Fastq 下载神器!
导言 前几天看到基因课的东哥提了一下kingfisher,一个看起来就是极度便利的公共测序数据下载工具.我非常感兴趣,但也确实没时间折腾,于是继续丢给师弟去看看(事实上,他肯定也有类似需求....). ...
-
宏基因组分析专题(5):从宏基因组数据中得到高质量的基因组数据- MetaBAT的安装和使用
生科云网址:https://www.bioincloud.tech 本文由微科盟phage根据实践经验而整理,希望对大家有帮助. 微科盟原创微文,欢迎转发转载,转载须注明来源<微生态>公众 ...
-
单细胞转录组数据处理之上游分析流程
如果你想亲手分析自己的数据,生信技能树联合单细胞天地也推出了:7个小时的单细胞转录组视频课程(限时免费) 足足7个小时,34集,涵盖了单细胞转录组背景知识以及数据处理的知识体系,希望能够帮助到你的课 ...
-
B站单细胞转录组视频课程学习者笔记全
其实公布在B站的单细胞转录组视频课程也有3个小时的教学量,到现在半年时间过去了,收获超5000的学习量,如下: https://www.bilibili.com/video/av38741055 值得 ...
-
单细胞转录组:Smart-seq 2还是10X Genomics Chromium?
置顶易基因科技 2020-07-06 14:57:37 版权声明:本文为博主原创文章,遵循 CC 4.0 BY-SA 版权协议,转载请附上原文出处链接和本声明. 本文链接:https://blog.c ...
-
单细胞转录组数据处理综述
很久以前无意中翻译过一篇单细胞的新闻,单细胞测序 也关注过这方面进展,北大谢晓亮组又更新了他们的单细胞全基因组扩展方法 正好我们博士阶段有一门课是写一个综述系统性的总结一个研究领域,我就很自然的选择了 ...
-
单细胞转录组课程笔记
单细胞转录组数据的R语言初步分析 最近参加了群主的单细胞转录组课程,根据指示从GIthub下载单细胞转录组表达矩阵数据,https://github.com/jmzeng1314/scRNA_smar ...
-
单细胞基础视频课程结业考核20题
转眼间一年时间过去了,我们的全网第一个单细胞基础视频课程也结束了,还有点依依不舍. 不知道大家学的怎么样,我这边看起来线下学徒和实习生都学的挺好的,还有详细的笔记分享,考虑到大部分人是没有机会线下接受 ...
-
参考基因组用错了单细胞转录组流程照样可以走通
前些天我发布了 cellranger更新到4啦,提到了可以免费做一下10X的单细胞转录组数据上游分析,反正刚刚购买的服务器闲着也是闲着.然后,马上就有粉丝寄给我了一个2.4T硬盘,里面有24个10X单 ...
-
10X的单细胞转录组原始数据也可以在EBI下载
众所周知,测序数据单端测序就是一个fq文件,双端测序就2个.但是呢,10X的单细胞转录组原始数据的话, 比较特殊,它的测序文库中包括index.barcode.UMI和测序reads. 首先,1-26 ...
-
10X单细胞转录组的测序数据量这么少是为什么
最近读到发表在nature medicine杂志的文章<Immune profiling of human tumors identifies CD73 as a combinatorial t ...
