WGCNA分析+公共数据库挖掘你感兴趣的癌症 / 开普饭

在ncRNA还没有研究之前,好多表达谱芯片是没有ncRNA的注释信息的.这也就导致说很多表达谱的芯片,没办法分析ncRNA.对于芯片的探针而言,可以通过重注释的办法来看一下是否能重新获得一部分ncRN ...

有小伙伴后台留言说想知道 GEPIA 数据库的用法,正好最近一段时间GEPIA2更新了,其中也更新了一些新的功能.所以就趁着这个机会给大家介绍一下GEPIA2吧. 有小伙伴后台留言说想知道 GEPIA ...

研究背景: 角蛋白(KRTs)是上皮细胞的中间细丝形成蛋白,被广泛用作癌症的诊断生物标志物,并与多种癌症的肿瘤发生和转移有关.然而,KRTs在黑色素瘤中的多种表达模式和预后价值尚未阐明. 研究方法: ...

解螺旋公众号·陪伴你科研的第2520天高分生信生信文章怎么做? 今天为大家带来一篇影响因子高达8.9分的一篇分析基因家族的生信文章,影响因子虽高,但复现难度却不大,借鉴意义非常大,性价比如此高的文章 ...

研究背景: 卵巢癌在全球与妇科癌症相关的死亡中排名第五.到目前为止,尚未完全了解卵巢癌的肿瘤发生和预后的分子机制.这项研究旨在发现参与卵巢癌的hub基因和治疗药物. 研究方法: 从Gene Expre ...

怎样才能不做实验,不用R语言,还能发3分+SCI? 今天介绍几个可以用得上的数据库,只利用数据库中的数据进行分析,甚至不用R,利用在线分析工具,敲敲电脑就能解决急需发文章,没时间做实验,没有科研经费的 ...

从目前发表的许多文章来看,做单基因纯生信分析的思路大多是迎合已经发表的大型研究,很难单独依靠挖掘公共数据库而发现一个功能强大的新基因,主要原因有两个: 1.在肿瘤研究中,功能强大的基因很多早就已经被研 ...

GEPIA, 全称GeneExpression Profiling Interactive Analysis.这个数据库是2017年7月由北京大学张泽民教授团队的唐泽方等人通过 R .Perl等语言对 ...

2021年新的开始,现在还能靠纯网页分析发高分生信吗?答案是:YES!今天给大家介绍的是去年9月份发表在frontiers in Oncology (IF=4.848)的一篇文章,主要内容是基因家族c ...

GEPIA(http://gepia.cancer-pku.cn/index.html)这个工具可以说是分析TCGA数据库数据分析工具中比较简单好用的工具了,包括生存分析,表达差异分析,相关性分析等, ...

有小伙伴说想知道GEPIA数据库的用法.正好最近一段时间GEPIA2更新了,其中也更新了一些新的功能.所以就趁着这个机会给大家介绍一下GEPIA2吧.昨天我们介绍了其中一部分,这里我们来说一下后面的一 ...

在本项研究中,作者利用加权基因共表达网络分析(WGCNA)阐明与脊髓损伤(SCI)相关的特定模块和中枢基因.首先,作者从GEO数据库下载基因表达谱GSE45006和GSE2599,通过WGCNA分析识 ...

解螺旋公众号·陪伴你科研的第2562天零代码复现基因家族分析今天我为大家带来一篇发表在Frontiers in Oncology杂志上,影响因子为4.848的一篇分析基因家族的生信文章,之前我复现 ...

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