16s分析之网络分析一(MENA) / 开普饭

最近,对比学习(CL)已成为一种无监督的图表示学习的非常热门的方法.大多数图CL方法首先在输入图上进行随机扩充,得到两个视图,并使两个视图的表示一致性最大化.尽管图CL方法得到了长足的发展,但图增广方 ...

前言随着近几年关于复杂网络(Complex network)理论及其应用研究的不断深入,已有大量关于复杂网络的文章发表在Science,ature,RL,NAS等国际一流的刊物上,侧面反映了复杂网络 ...

Scale-free networks are rare 强无标度网络在现实网络中的罕见性论文作者: Anna D. Broido, Aaron Clauset(科罗拉多大学波德分校) 论文链接: ...

0 引言目前,室内过度照明等电力浪费现象随处可见.不科学的照明工程极大地浪费了能源.随着现代科学技术的发展和人们生活水平的提高,传统照明已不能满足现代社会对高效.自动化和节能照明技术的需求.作为发展 ...

一.复杂网络的基本概念前面我们在<多主体建模和智能优化算法>一文中,介绍过实际网络, 有了这些实际网络,我们就要对它进行研究.在研究之前,我们必须把它抽象成可以用数学进行描述的问题,即复 ...

如何使用netwokx进行复杂网络的中心性分析? 这是本学期在大数据哲学与社会科学实验室做的第七次分享了. 第一次分享的是: 如何利用"wordcloud+jieba"制作中文词云 ...

Network layout in NCC style 2021年初,周集中团队在Nature Climate Change杂志上发表了一篇气候变暖对微生物网络复杂性与稳定性影响的文章见下文 Natu ...

福利公告:为了响应学员的学习需求,经过易生信培训团队的讨论筹备,现决定安排扩增子16S分析.宏基因组.转录组的线上/线下同时开课.报名参加线上直播课的老师可在1年内选择参加同课程的一次线下课 .期待和 ...

俄亥俄州立大学Ann L. Griffen等人于2018年9月5日在<Microbiome>发表了题目为<High-resolution ISR amplicon sequencin ...

福利公告:为了响应学员的学习需求,经过易生信培训团队的讨论筹备,现决定安排扩增子16S分析.宏基因组.转录组的线上/线下同时开课.报名参加线上直播课的老师可在1年内选择参加同课程的一次线下课 .期待和 ...

对otu的差异分析并不是我们唯一的选择,差异往大的做,可以往往门,纲,目,科做. 今天要做一张长的图,我们可以和别的图一起配合使用会好? 比如这篇文章,还是挺好看的: 下面是一份完整的代码,我仅仅只做 ...

一次偶然的机会我看到了这篇文章,发表于Cell Host & Microbe上,这个期刊也不怎么熟悉,就点了WB上的期刊信息: Systematic Characterization and ...

上回我们说到,R语言16s进化树的构建,单单一个优秀的进化树对于我们不是做进化的人来讲,还是不够,有些华而不实,但是Y叔这个ggtree功能当然不止如此,Y叔也经常宣称其为真正的'支持图形语法':相比 ...

之前我便说过,16s出图主要是用R,自这两年来Y叔的ggtree出来,好评不断,引用不断攀升这里当然借用Y树的包来做我们的进化树,当然Y叔公众号讲的更加深入和详细,有需要请关注:biobabble ...

突然有一天,师兄对我说,这么长时间了差异分析做了没啊?额,差异分析?之前不是做过吗?我开始 library(edgeR) :不是这个,那个 LEfSe!好吧,那就做 LEfSe 吧!什么是 LEfSe ...

前两天我向大家推了16s做差异分析的两个包(没有看的请点击下面链接): 1.16s分析之差异分析(DESeq2) 2.16s分析之差异OTU 挑选(edgeR) 差异做出来了如何展示,也是一个值得思考 ...

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