给你tcga数据库过万病人的原始测序数据你可以做什么 / 开普饭

miRNA作为ncRNA的一类.其主要发挥功能的主要方式是通过和基因形成双向互补链进而来影响基因的表达.因此通过miRNA和基因序列是否互补就可以遇到miRNA可能的靶基因了.这个基本上就是经典的预测 ...

写在前面我们在使用TCGA数据库的时候,从TCGA数据库下载到的数据,使用的原始数据ID是ENS ID.对于这样的ID号,我们一方面不认识他们是什么,另外如果要做下有分析的话,很多数据库也不接受这样 ...

要分析测序数据,一般都会想到的是TCGA (当然GEO上也有部分的测序数据).但TCGA上只有肿瘤的相关研究,我们如想要研究其他疾病,甚至研究其他物种的测序数据, 其实可以看点别的,比如上EMBL-E ...

一文学会集美貌与实力于一身的TANRIC数据库嗨,小伙伴们大家好!这里是弘毅专栏~每周一给大家分享一个数据库实操教程! 这次弘毅给大家带来的是一款集lncRNA注释和表达信息.可视化和临床相关分析等 ...

我们知道,在lncRNA的研究当中,传统的lncRNA相关的ceRNA网络已经算是比较老的研究套路了.那如果在lncRNA这个老树上找到新的方向呢?今天就介绍一个可以预测lncRNA可变剪切的数据库 ...

一个文章套路的小故事 TCGA原始的数据库只有表达组学.甲基化.临床信息这些数据,所以大家在挖掘数据,最基本的就是在这几个组学里面来回的交叉融合.如果一个癌种别人交叉分析了,那其实基于基础的思路很难再 ...

今天继续我们TCGA在线数据库系列.今天介绍的数据库是LinkedOmic,http://www.linkedomics.org/login.php可谓是航母级数据库,没有做不到的,只有想不到的.话不 ...

今天继续我们TCGA在线数据库系列.今天介绍的数据库是LinkedOmic,http://www.linkedomics.org/login.php可谓是航母级数据库,没有做不到的,只有想不到的.话不 ...

我们在研究基因对于某一个疾病预后是否有影响的时候.最直接的就是单纯的做这个基因对所有患者的预后分析.如果预后有意义,就说明这个基因影响疾病的预后.如果没有意义就说明这个基因不重要的嘛?当然也不是的.疾 ...

我是小助理启帆医学专注于SCI量身定制,SCI免费评估. SCI翻译润色.SCI发表协助:职称/硕博论文写作:科研课题标书设计撰写.如果有需要,您可以随时和我联系~~ 题目:Construction ...

关于 TCGA 数据库当中的可变剪切事件而言,其中最出名的还是 [[TCGA Spliceseq-可变剪切相关数据库]].在 Spliceseq 数据库当中通过 PSI 这个指标来评价了不同基因转录本 ...

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