TCGA数据库 ID转换问题 / 开普饭

通常,基因融合会产生基因融合转录本和嵌合蛋白产物,它们已被用作治疗的靶标.众所周知的例子是靶向BCR-ABL1基因融合的格列卫(Imantinib)和靶向EML4-ALK基因融合的克唑替尼.所以很多癌 ...

要分析测序数据,一般都会想到的是TCGA (当然GEO上也有部分的测序数据).但TCGA上只有肿瘤的相关研究,我们如想要研究其他疾病,甚至研究其他物种的测序数据, 其实可以看点别的,比如上EMBL-E ...

TCGA转录组数据在完成差异分析后,我们通常希望系统地获取这些成百上千的差异基因的功能信息,帮助我们分析下游实验的思路.面对大量的差异基因,逐个查询基因功能是不切实际的.所以我们需要借助基因功能富集分 ...

咱公众号也不能只做一个系列,所以经过深思熟虑,打算将来慢慢增加一些内容,主要有以下几个系列 TCGA数据分析系列 GEO数据分析系列 "老板给一个基因,我该怎么办"系列文献阅读系 ...

分析基本思路: 1.首先我们应该要知道什么是肿瘤的免疫细胞浸润模式,通过一些什么样的原理,可以用什么样的软件进行分析. 肿瘤免疫细胞浸润是指免疫细胞从血液中移向肿瘤组织,开始发挥它的作用,可以从肿瘤组 ...

写在前面昨天我们介绍了三个ID转换的工具: DAVID.g:Convert 以及 biomart,但是这个工具内置的数据怎么样并不清楚,所以今天就来评价一下这几个工具吧. 数据准备由于我们使用最多 ...

<KUWO音乐网ID转换MP3网址(歌词)>能将酷我音乐网的音乐ID转换为可供外链的MP3网址,如该歌曲配有动态歌词,就会转换为LRC歌词.如果转换成功立即播放.显示同步歌词,并可复制转换 ...

让我们一起科研吧~ 小燕子肿瘤微环境是当前研究的一个热点,无论是国自然还是发SCI,都是比较热的点,那么,数据挖掘也不例外,很多人喜欢追随这样的热点.(肿瘤微环境是指肿瘤的发生.生长及转移与肿瘤细胞 ...

实际上掌握了编程的思维,任何一门语言都可以做id转换! 对于初学者来说,这个是非常实用的一个,很多人当初就是因为要做这个转换,才慢慢走入了编程的道路. 使用大部分软件的时候,第一步就是文件数据准备,基 ...

长期更新列表: 使用R语言的cgdsr包获取TCGA数据(cBioPortal)TCGA的28篇教程- 使用R语言的RTCGA包获取TCGA数据 (离线打包版本)TCGA的28篇教程- 使用R语言的R ...

TCGA数据库 ID转换问题