读书笔记（R语言） | 生信菜鸟团 / 开普饭

R语言学习贴往期回顾 R学习:R for Data Science(一) R学习:R for Data Science(二) R学习:R for Data Science(三) R学习:R for D ...

作者:amitvkulkarni CDA数据分析师编译概述对于任何评估来说,最难的是保持简单易操作,在数据科学中也是如此.在任何数据科学项目中,细化数据.微调模型.部署它们的迭代过程都是一个持续的 ...

原文链接:http://tecdat.cn/?p=11664 我想研究如何使用pymc3在贝叶斯框架内进行线性回归.根据从数据中学到的知识进行推断. 贝叶斯规则是什么? 本质上,我们必须将已经知道的知 ...

今天学到pandas的一个扩展库- pandas-profiling,该库可以从dataframe中生成报告文件.实际上df.describe()就是能实现类似的功能,但是对于数据分析初期的数据探索略 ...

关于多期did的模型问题老师您好,我在做多期did的模型,我发现treat*post的取值和post的取值是一致的,那么在写ols模型时,是不是只需要引入post*treat和treat两个变量,去 ...

原文链接:http://tecdat.cn/?p=17375 为了帮助客户使用POT模型,本指南包含有关使用此模型的实用示例.本文快速介绍了极值理论(EVT).一些基本示例,最后则通过案例对河流的极值 ...

NewBeeNLP 永远有料,永远有趣 199篇原创内容公众号在前面一篇文章中,总结了Representation-Based文本匹配模型的改进方法, 基于表征(Representation)的文 ...

关于R语言包的一些操作,挺重要的!!! R的包(package)通常有两种: 1 binary package:这种包属于即得即用型(ready-to-use),但是依赖与平台,即Win和Linux平 ...

为了能更方便的查看,检索,对文章进行了精心的整理(PLUS).建议收藏,各取所需,当前没用也许以后就用到了呢! R资料+计划 R语言精品资料年中无套路赠送 R-plotly|交互式甘特图(Gantt ...

为了分析不同类型.组织起源肿瘤的共性.差异以及新课题.TCGA于2012年10月26日-27日在圣克鲁兹,加州举行的会议中发起了泛癌计划.参考:https://www.ncbi.nlm.nih.gov ...

其实我现在已经不写软件教程了! fastqc对原始测序reads质控 NCBI的blast++软件使用说明书 SRA工具sratoolkit把原始测序数据转为fastq格式目录一:下载安装该软件 ...

生信常用论坛seq-answer里面所有帖子爬取生信常用论坛bio-star里面所有帖子爬取这个是爬虫专题第一集,主要讲如何分析bio-star这个网站并爬去所有的帖子列表,及标签列表等等,前提是 ...

目录如下: 生信人必学ftp站点之NCBI-GEO 脚本作业-解读NCBI的ftp里面关于人的一些基因信息 NCBI的taxid简单介绍 NCBI的基因entrez ID相关文件介绍请直接看我博客吧 ...

这个我非常喜欢,目录如下: 用R获取芯片探针与基因的对应关系三部曲-bioconductor 用R获取芯片探针与基因的对应关系三部曲-NCBI下载对应关系 gene的各种ID转换终结者-biocond ...

主流有3个,我只介绍了两个: 用crossmap代替liftover做基因组坐标转换 liftover基因组版本直接的coordinate转换其实国际三大主流生物信息学数据库运营单位都出了自己的基因 ...

搞生信研究的,大部分数据都是针对于人类的,那么人类的参考基因组就不得不知了! 与hg19的突变相关的一些数据解释. Hg19基因组的分析 R的bioconductor包TxDb.Hsapiens.UC ...

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