科研 | Environment International：宏基因组和宏转录组联合揭示人、鸡和猪肠道微生物组中差异表达的抗性组 / 开普饭

本文由Bayegy根据实践经验而整理,希望对大家有帮助. 原创微文,欢迎转发转载. 导读所谓宏基因组学 (或元基因组学, metagenomics) 就是一种以环境样品中的微生物群体基因组为研究对象 ...

编译:Jonie.song,编辑:十九.江舜尧. 原创微文,欢迎转发转载. 导读世界人口增长的同时,对食物的需求也越来越多,尤其是蛋白质.反刍动物作为高蛋白的供应源,起着关键作用,其瘤胃发育关系到将 ...

编译:Mushroom,编辑:小菌菌.江舜尧. 原创微文,欢迎转发转载. 导读微生物在瘤胃消化代谢过程中发挥重要的作用,对牛的饲料转化率有显著影响.然而,肉牛品种对瘤胃微生物群落的影响程度及其与饲料 ...

编译:jiee,编辑:小菌菌.江舜尧. 原创微文,欢迎转发转载. 导读海洋微生物群落极大地影响着地球的生物地球化学循环.食物网和气候.尽管最近在理解海洋微生物的物种和基因组组成方面取得了进展,但对其 ...

本文由流年梦编译,十九.江舜尧编辑. 原创微文,欢迎转发转载. 导读河口沉淀物中细菌菌群扮演着人类污染物的生物修复和能量转化的角色,特别是多环芳香烃(PAHs).但是目前在PAHs胁迫下微生物之间的 ...

本文由流年梦编译,玛莉.江舜尧编辑. 原创微文,欢迎转发转载. 导读在极端富铁和富硫环境中存在多种未培养的微生物,在铁和硫元素的生态循环中发挥着重要的作用,但是它们的生物多样性和生态功能并不清楚.本 ...

一句话:菌群结构谱是研究团队(菌群)有什么人及各种人的比例:宏基因组是团队能做什么:宏转录组是团队准备做什么:宏蛋白质组是团队在做什么:宏代谢组是团队做了什么. 小钱用菌群结构谱,大钱用宏基因组,烧钱 ...

[TOC] 写在前面这是对宏基因组提取扩增子序列16S分析的第二部分,这部分将核糖体RNA基因组装后进行分析.上一节我们使用了 bbmap提取了核糖体序列,但是单纯用于ASV的方法聚类是不行的,以为 ...

全部样本全部样本混合拼装 mkdir ./assemblyall/ megahit --continue --out-dir ./assemblyall/megahit/ -m 0.9 -t 6 - ...

[toc] 写在前面从宏基因组中提取核糖体DNA序列,进行扩增子分析.扩增子数据的分析我们已经熟悉的非常熟悉了,只是从宏基因组中得到,这个过程不够熟悉.其次你以为直接提取出来的序列,直接上vseea ...

科研 | Environment International：宏基因组和宏转录组联合揭示人、鸡和猪肠道微生物组中差异表达的抗性组