专注于Agilent microRNA 芯片数据的处理R包-AgiMicroRna / 开普饭

"Pan-Cancer Analysis of HumanKinome Gene Expression and Promoter DNA Methylation Identifies Dar ...

对于高维度的数据分析而言,例如RNA-seq的数据.我们在得到数据想要解释不同分组之间的差异的基因.往往都需要逐渐的降维来进行解释.最普遍的方法通过差异分析-富集分析这样的也算是一种逐步降维的操作.这 ...

一.5月14日热点前瞻热点一:国产芯片逻辑概述:13日晚中芯国际发布一季度财务数据,营收同比增长35.3%,创历史新高.公司决定将2020年资本开支进一步上调至43亿美元,以充分满足市场需求. 相 ...

为什么会有这个需求呢?很简单,因为国内的一些基因检测公司支持导入23andme的芯片数据做解读,而我正想看看一下他们的技术功底到底如何? 23andme和wegene都是用的一款特制的芯片,可以捕获基 ...

这个需求比较少见,主要是因为有很多朋友都做了基因检测芯片数据,而芯片检测的结果只有4列,分别是dbSNP数据库ID号,染色体,坐标,还有基因型.如下: head -100 wegene.txt |ta ...

作者是生信技能树组建的表观遗传学学习小组的小组长,前面已经发过一个: 学员分享-Chip-seq 实战分析流程本文是看到生信技能树有个450K甲基化芯片数据处理传送门,我呢,恰好不久前用一个集成度很 ...

本讲涉及到的芯片分别是: GSE7762 GSE62346 GSE50382 视频里的示例会带领大家使用 GEOquery 包里面的getGEO函数下载每个表达芯片数据在GEO数据库里面的数据,解析获 ...

早在我们举办甲基化芯片专题学习的时候,见: 450K甲基化芯片数据处理传送门就有非常棒的一站式教程投稿,也因此我结识了优秀的六六,以及其教程大力推荐的R包作者,见: 850K甲基化芯片数据的分析但 ...

最近看的一个很有趣的文献,里面很直白的说自己的差异分析得到的基因集,跟前面两个研究的基因集,完全没有重合之处,但是作者给了比较合理的解释,所以想分享给大家. image-201910311159322 ...

最近接到学徒求助,在广州,导师给了她分析cnv芯片的任务,调研文献发现,数据集很可怕,30G的芯片数据感觉下到猴年马月都不一定能成功! 我很少在中国大陆真正的下载数据并且处理,我打开https://w ...

简介入门生物信息学我们首先需要有可分析数据,才能进行后续操作.但目前国内网络环境的限制,使得我们很难畅快地从各大数据库下载数据.今天就为大家推荐一种简单快捷的下载方式--使用VPS下载,再使用Fil ...

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