物种丰度排序堆积柱形图及处理间各物种差异分析 / 开普饭

写在前面堆叠柱状图做成环状,得益于Y叔的ggtreextra,因为我不仅仅要做成环状,还要添加聚类模块.所以就不太好办了.这种展示在样本很少的情况下其实不是很好,但是当样本很多的时候,尤其是上百哥, ...

AA:=C/REF(C,1)>1.094 AND C=H; 强势:=COUNT(AA,10)>0;{10日内有过涨停} CC:=V/REF(V,1)>3; 天数:=BARSLAST( ...

前言一般而言,我们做完pathway富集分析,就做下气泡图或bar图来进行展示,但它们实际上只考虑了富集因子和Pvalue.如果我们不关注这两个因素,而是在乎样本本身的pathway丰度呢? 对于K ...

昨天的我可以为你做些什么好像阅读量不高,不过效果还是蛮显著的,跟部分粉丝聊了聊,希望对他们有帮助吧! 我们的生信故事会一直在征稿,详见:生信故事会栏目征稿启事下面分享一下最新投稿,讲述跨专业转行学习 ...

R语言完整的Lefse分析写在前面怎么说呢,我在之前的推送中,在R语言中实现了LEFse分析过程.但是我没有将数据前处理和结果的物种分类图形做出来.这是一定要在R语言中操作的,要不然,仅仅是实现了 ...

写在前面 2020年2月19日,疫情还在继续,相信持续不了多久了.还在假期中,但还是可以持续发光发热的.今天我为大家带来词云,词云这种出图方式实际上再各个领域都有比较广发的引用,尤其是引文分析,广告等 ...

前面的学徒作业系列有一个是<数据挖掘>学习班的学员提问:绘图本身很简单但是获取数据很难.本来呢,我是安排给了转录组讲师,希望她可以把这个解决方案制作好PPT给大家做一节公开课的. 但是奈何 ...

上一期给大家介绍了用Graphpadprism绘制细胞周期图,不知道大家学会了没有.今天这期小编想给大家介绍如何使用Graphpad prism绘制另外一种常用的叠加柱状图--物种相对丰度图,它在微生 ...

原文链接:http://tecdat.cn/?p=23836 我们使用R中的igraph包,产生了网络的图形. 但是很难将这些图表放到演讲和文章中,因为图表很难根据需要定制.使用igraph中的绘图功 ...

小伙伴们,上一篇中我们留了一个问题,Bacteridoes的标注方法是1,2*,3,4,你答对了吗?这一篇中将讲解当数据方差不齐的时候,如何用非参数检验比较组间差异,特别提醒下面演示的功能,只有spa ...

大家都知道,微生物菌群研究是当前医学.膳食营养组学.农牧生态学研究的热点,其中差异菌群或者核心特征菌群的检出是揭示干预效果和机制解析的重要前提.那么如果对不同分类水平的菌群丰度进行比较分析呢? t检验 ...

编译:微科盟有点卡,编辑:微科盟木木夕.江舜尧. 微科盟原创微文,欢迎转发转载. 导读地上凋落物是土壤食物网的重要的能量来源,但越来越多研究证明,对于土壤生物而言,根系碳可能扮演着更重要的角色.植物 ...

编译:李子苹果桃,编辑:木木夕.江舜尧. 原创微文,欢迎转发转载. 导读 Epichloë内生真菌仅存在于禾草地上组织中,通过增加凋落物返田和根系分泌物而间接影响土壤生物学特性.据报道,Epichlo ...

编译:独世,编辑:小菌菌.江舜尧. 原创微文,欢迎转发转载. 导读越来越多研究表明微生物组与多种人类疾病之间存在一定的关联,例如肥胖.炎症性肠病.HIV等.进行微生物组广泛关联研究的第一步是在不同条 ...

编译:环境微生物学Rivc,编辑:小菌菌.江舜尧. 原创微文,欢迎转发转载. 导读树木砍伐是全球关注的问题,主要原因通常不明.氮(N)的波动与酸化化合物之间的复杂相互作用已被提出,是造成养分失衡和降 ...

物种丰度排序堆积柱形图及处理间各物种差异分析