序列比对在biopython中的处理 / 开普饭

昨天发布了 GEO数据库中国区镜像横空出世,粉丝们都很happy,因为确实解决了他们的一个拦路虎,以后下载GEO数据再也不用去网吧了.但是部分粉丝提出了更过分的要求,说自己没有服务器,我以前的教程:( ...

写在前面我们在处理GEO芯片数据的时候,经常会碰到芯片的数据的注释文件没有提供基因名,只有基因的序列.替代的解决办法就是对所有的注释数据来进行批量的blast,利用注释文件提供的序列来通过blast ...

通过进化树,我们可以得到一些非常有价值的信息,比如说某几个物种在同一分支上,说明他们有着较近的亲缘关系,更有可能他们之间存在着祖先与进化的关系.比如最近来势汹汹的新冠肺炎,下图为从网上找的冠状病毒遗传 ...

咱们<生信技能树>的B站有一个lncRNA数据分析实战,缺乏配套笔记,所以我们安排了100个lncRNA组装案例文献分享,以及这个流程会用到的100个软件的实战笔记教程! 下面是100个l ...

Ashtanga vinyasa yoga 总有六个系列,第一系列Yoga chikitsa练习对身体起到理疗和修复的功效.从中感受理解瑜伽经八支的实修过程持戒(Yama).精进(Niyama).体位 ...

研究人员最近发现了一个被称为VNTR2-1的DNA区域,它似乎可以驱动端粒酶基因的活性,而端粒酶基因已经被证明可以防止某些类型细胞的衰老.了解端粒酶基因是如何被调控和激活的,以及为什么它只在某些细胞类 ...

人体本质上是由数万亿个活细胞组成,这些细胞停止复制和分裂时就出会现细胞衰老,而人体也会随着细胞的衰老而衰老.我们早已知道基因会影响细胞的衰老方式和人类的寿命,但它们究竟是如何运转的目前仍不清楚. 端粒 ...

打开腾讯新闻,查看更多图片 > 人体本质上是由数万亿活细胞组成的.随着细胞的衰老,当这些细胞最终停止复制和分裂时,这些细胞就会变老.科学家们早就知道基因会影响细胞的衰老和人类的寿命,但是这到底是 ...

进化树以树状结构形象的展示各个节点的进化关系,在物种进化,亲缘关系研究领域广泛应用.在biopython中,通过Bio.Phylo子模块,可以方便的访问和展示树状结构中的信息 1. 读取文件树状结构 ...

文本型的序列,有一种比较特殊的就是"001"类型的了,如果直接输入的话,软件会自动变为1,下面小编就来教大家如何输入吧! 1.打开Excel表格,直接在单元格中输入"00 ...

作为一名瑜伽老师,除了授课外,自己日常的进阶是必不可少的,对于瑜伽老师们来说,日常练习内容难度.强度和练习的频率都要有所区别. 所以,今天就分享10套序列,特别适合进阶的瑜伽老日常练习,还可以运用到有 ...

全部样本全部样本混合拼装 mkdir ./assemblyall/ megahit --continue --out-dir ./assemblyall/megahit/ -m 0.9 -t 6 - ...

问题描述示例:如何查找有序序列中某一的元素输入:[1,2,3,4,5,6,--,100] 61 #查找的元素输出:61解决方案查找元素.一般地,我们可以用for循环进行遍历,再用if语句进行查找. ...

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