lncRNA芯片的探针到底该如何注释到基因组信息呢 / 开普饭

转录组学习一(软件安装)转录组学习二(数据下载)转录组学习三(数据质控)转录组学习四(参考基因组及gtf注释探究)转录组学习五(reads的比对与samtools排序)转录组学习六(reads计数与标 ...

关键词:零基础:叶绿体基因组:神器:国人佳作:一键成环. 软件官网:https://github.com/Kinggerm/GetOrganelle GetOrganelle 这款软件是建军和郁文彬老 ...

bwa使用Burrows–Wheeler Transform (BWT)算法,利用backward搜索,针对不同reads长度,有三种算法「BWA-backtrack」, 「BWA-SW」和「B ...

今天是生信星球陪你的第529天大神一句话,菜鸟跑半年.我不是大神,但我可以缩短你走弯路的半年~ 就像歌儿唱的那样,如果你不知道该往哪儿走,就留在这学点生信好不好~ 这里有豆豆和花花的学习历程,从新手 ...

第一次是:TCGA的28篇教程-风险因子关联图-一个价值1000但是迟到的答案第二次是:(重磅!价值一千元的R代码送给你)芯片探针序列的基因组注释其中第二个教程是纯粹的R代码技巧,怕粉丝看不懂,我 ...

最近在答疑群里收到一个很经典的提问,就是: 请问各位老师,GPL570芯片中应该有部分基因是LncRNA,能否通过基因重注释的方式把有意义的LncRNA筛选出来呢?R语言能否实现呢? 而且学生特别的好 ...

最近在做illumina的甲基化芯片数据处理知识整理,所以看了不少文献咯,发现甲基化探针到底需要进行哪些过滤这么一个小细节,值得探讨的都很多.欢迎大家加入我们的讨论群:一个甲基化芯片信号值矩阵差异分析 ...

最近收到读者求助,说他感兴趣的表达量芯片数据集用到的的芯片是:[HT_HG-U133_Plus_PM] Affymetrix HT HG-U133+ PM Array Plate ,看起来跟我们授课的 ...

[4月23日讯]相信大家都知道,自从华为遭受到第二轮"芯片断供禁令"以后,华为"缺芯"似乎也成为了所有人的共识,毕竟我们从华为推出的智能手机以及备货量来看,就足 ...

一.lncRNA芯片长链非编码RNA(long non-coding RNA, lncRNA) 指的是长度在200-100000 nt之间的RNA分子,它们不编码蛋白,但参与细胞内多种过程调控.人们 ...

使用bioconductor注释包如果该芯片平台有对应的bioconductor注释包,只有约90个常用的芯片有! 比如: library(hgu133a.db) ids=toTable(hgu13 ...

前面我们系统性的总结了circRNA的相关背景知识: 首先了解一下circRNA背景知识 circRNA芯片分析的一般流程 circRNA-seq分析的一般流程 ceRNA-芯片分析的一般流程同样的 ...

lncRNA芯片的探针到底该如何注释到基因组信息呢