如何查找miRNA与某种癌症的关联？ / 开普饭

所有的经验都是我在开发CancerMIRNome数据库 (http://bioinfo.jialab-ucr.org/CancerMIRNome) 的过程中积累的. CancerMIRNome是一个癌 ...

该数据是我自己下载整理过的数据. 下载日期:2021年8月25日下载方式:TCGAbiolinks包数据类型:RData 变量名称:mir_Count:mir_RPM path <- dir ...

YM500v2是用于个人smRNA-seq数据集的miRNA定量,是miR鉴定和新型miRNA预测的集成数据库.YM500v2中包含了YM500之后开发的与miRNA相关的新算法,更重要的是,纳入了8 ...

SomamiR是microRNA(miRNA)及其靶点中癌症体细胞突变的数据库,集成了多种类型的数据,用于研究体细胞和种系突变对癌症中miRNA功能的影响.数据库还提供了存在miRNA靶序列体细胞突变 ...

我是小助理临床科研两手抓启帆医学专注于SCI量身定制,SCI免费评估. SCI翻译润色.SCI发表协助:职称/硕博论文写作:科研课题标书设计撰写.如果有需要,您可以随时和我联系~~ 数据挖掘这块儿 ...

之前我们介绍了很多TCGA方面的数据库.其中GEPIA只能用来分析表达数据库各个方面的.cBioPortal可以进行多组学分析,但是一般都是分析自身基因和自身突变等等的关系.至于CVCDAP分析的则是 ...

我们熟知,在特定情况下,microRNA(miRNA)可以直接或间接激活和抑制基因表达.但是,尚没有基于多组学的数据库能够证明对激活与抑制以及正常与癌症状况之间相互作用模式转换的系统数据.今天我们为大 ...

俗话说,好记性不如烂笔头,小编痛定思痛,决定先整理一份miRNA相关数据库的保姆级教程分享给大家,说不定哪天就用上了呢.好,上正餐! 1. TargetScan:http://www.targetsc ...

前几天有小伙伴问关于 miRNA 的数据库,由于 miRNA 相关的数据库太多了,要是分开介绍的话估计要好久好久.幸好,有人已经把 miRNA 相关的数据库整理好了,我们只需要基于自己的目的进行查找就 ...

lncRNA中的SNP及其对lncRNA的影响怎么做?疾病中lncRNA的表达是什么? 这样的小问题,LncRNASNP大可爱都能解决. lncRNASNP的构建图 IncRNASNP 是提供人.小鼠 ...

从miRNA出发,预测其调控的靶基因,另外是从靶基因出发,预测能调控该靶基因的miRNA,即双向预测.其中基因的编号支持Gene symbols ,EntreIDs和 Ensemlb-IDs.操作也是 ...

如何查找miRNA与某种癌症的关联？