EpiDISH-根据甲基化信号值推断样品的细胞成分 / 开普饭

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m 6 A regulator-mediated methylation modification patterns and tumor microenvironment infiltration c ...

肿瘤相关成纤维细胞(cancer-associated fibroblasts,CAFs)是肿瘤微环境中最主要的成分之一,在肿瘤的发生发展中发挥着必不可少的作用.肿瘤相关成纤维细胞由于不同的起源而具有 ...

Prognostic and predictive value of PD-L2 DNA methylation and mRNA expression in melanoma PD-L2甲基化和m ...

虽然MC目前2018年的IF是10.679,但是我们之所以说是15+分呢,是因为MC在6月就要公布在2019年的影响因子是15.96分,说不定还能在这段时间努努力,突破到16分! (图片来源:桑格助手 ...

氨基酸支持核酸和蛋白质修饰氨基酸为甲基化提供甲基.蛋氨酸除了对硫代谢具有重要作用外,还为蛋白质和核苷酸的甲基化提供甲基来调节它们的功能(图2和3).组蛋白和DNA甲基化可以通过改变DNA对转录复合物 ...

Multi-dimensional omics characterization in glioblastoma identifies the purity-associated pattern an ...

大家好,今天和大家分享的是2020年1月发表在Frontiers in Oncology(IF:4.848)上的一篇文章,"UBASH3B Is a Novel Prognostic Bio ...

甲基化的一些基础知识甲基化芯片的一般分析流程有意思的是,甲基化分析其实和普通的mRNA表达矩阵分析有很多概念问题是无法迁移的,包括质量控制,WGCNA分析,哪怕是简单的差异分析都有区别. 标准差异 ...

差异分析永远是最平易近人的策略,我们前面整理的各种系列教程,miRNA的,lncRNA的,mRNA芯片或者测序,circRNA系列的,都会得到表达矩阵,然后走差异分析.只不过是不同统计学分布的表达矩阵 ...

前面我们介绍了一些背景知识,主要是理解什么是DNA甲基化,为什么要检测它,以及芯片和测序两个方向的DNA甲基化检测技术.具体介绍在:甲基化的一些基础知识,也了解了甲基化芯片的一般分析流程 . 但是我留 ...

看到文章 PLoS Genet. 2016 ,提到了 CpG island methylator phenotype (CIMP) subtype 分组的细节 Methylation datasets ...

本来呢,这应该是一个教程,但最近是过年休假期间,我也不能无限制的回答粉丝提问,所以借<生信技能树>的便利给他发一个有偿求图的的宣传: 很可惜,我没有现成代码,所以无法"举手之劳& ...

栏目起源逆向收费读文献社群 (2018-01-07) 逆向收费读文献社群 (2018-06-09) 逆向收费读文献社群(第二年通知)(2019-01-26) 大概有50人加入吧,成功坚持下来的朋友们 ...

因为一个有趣的原因,我们来一起学一个R包吧一个背景哺乳动物基因组CpG位点通常集中在称为CpG岛(CpG island,CGI)的区域中,并且已知人基因启动子~60%含有CpG岛.CpG岛上下游不 ...

作者:肖建春肖健聪我们许多技术员在服务于养殖户时,都会用到测水,其中有一项指标就是酸碱度,对于这个酸碱度,总是认为在某一范围内,比如7.5至8.5之间就认为是正常的,当超过这一范围,就是认为不好. ...

当空白试验值偏高时,影响因素有很多,例如:试验用水.试剂.量器和容器的沾污.测量仪器的性能及试验环境的状态等,需要具体案例具体分析. 空白试验测得的结果称为空白试验值.在进行样品分析时所得的值减去空白 ...

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