甲基化信号值矩阵差异分析主要图表 / 开普饭

导语 DNA甲基化是当前研究最多的表观遗传修饰,对于促进胚胎发育,基因组印记和X染色体失活等重要生物过程至关重要.在甲基化研究的技术手段中,HM450K芯片在癌症甲基化组数据集中占主导地位.TCGA数 ...

和甲基化有关的. 可以先了解下甲基化: 450k甲基化基础 450K甲基化芯片数据处理传送门 450k甲基化芯片常用工具包:ChAMP和minfi等. 甲基化的一些预备知识甲基化程度的量化 imag ...

今天介绍一个特别的甲基化数据库:SurvivalMeth.SurvivalMeth是一个研究DNA甲基化对预后影响的新型数据库,由哈尔滨医科大学李霞教授团队开发,2020年8月份上线.数据库包含来自T ...

今天是生信星球陪你的第778天大神一句话,菜鸟跑半年.我不是大神,但我可以缩短你走弯路的半年~ 就像歌儿唱的那样,如果你不知道该往哪儿走,就留在这学点生信好不好~ 这里有豆豆和花花的学习历程,从新手 ...

前面我们介绍了一些背景知识,主要是理解什么是DNA甲基化,为什么要检测它,以及芯片和测序两个方向的DNA甲基化检测技术.具体介绍在:甲基化的一些基础知识,也了解了甲基化芯片的一般分析流程 . 但是我留 ...

甲基化的一些基础知识甲基化芯片的一般分析流程有意思的是,甲基化分析其实和普通的mRNA表达矩阵分析有很多概念问题是无法迁移的,包括质量控制,WGCNA分析,哪怕是简单的差异分析都有区别. 标准差异 ...

传统的甲基化信号值通常是芯片,比如illumina公司的27K,450K,850K的甲基化芯片,它们检查的通常是细胞混合物,比如绝大部分肿瘤组织样品其实是混合了上皮细胞,基质细胞和免疫细胞.如果我们感 ...

看到文章 PLoS Genet. 2016 ,提到了 CpG island methylator phenotype (CIMP) subtype 分组的细节 Methylation datasets ...

本来呢,这应该是一个教程,但最近是过年休假期间,我也不能无限制的回答粉丝提问,所以借<生信技能树>的便利给他发一个有偿求图的的宣传: 很可惜,我没有现成代码,所以无法"举手之劳& ...

栏目起源逆向收费读文献社群 (2018-01-07) 逆向收费读文献社群 (2018-06-09) 逆向收费读文献社群(第二年通知)(2019-01-26) 大概有50人加入吧,成功坚持下来的朋友们 ...

前面我们在生信技能树系统性介绍了大量RNA-seq相关背景知识,以及表达矩阵分析的一般流程 RNA-seq这十年(3万字长文综述) RNA-seq的counts值,RPM, RPKM, FPKM, T ...

因为一个有趣的原因,我们来一起学一个R包吧一个背景哺乳动物基因组CpG位点通常集中在称为CpG岛(CpG island,CGI)的区域中,并且已知人基因启动子~60%含有CpG岛.CpG岛上下游不 ...

在奇门遁甲演算中天盘九星法属于数理奇门中华先祖认为星宿作为参照可以推算地球上的气象物候和人心背向故而成为帝王之术九星的运行规律对人类的身心早已打上了时空烙印如果你想通过九星推算系统了 ...

甲基化信号值矩阵差异分析主要图表