使用pyscenic做转录因子分析 / 开普饭

参数化定义及参数化方式参数化的一般用法就是将脚本中的某些输入使用参数来代替,在脚本运行时指定参数的取值范围和规则:这样,脚本在运行时就可以根据需要选取不同的参数值作为输入. jmeter的test ...

关键词:零基础:叶绿体基因组:神器:国人佳作:一键成环. 软件官网:https://github.com/Kinggerm/GetOrganelle GetOrganelle 这款软件是建军和郁文彬老 ...

数据质控本小节数据已更新:https://github.com/taowenmicro/Megagenome_learing. 准备conda虚拟环境我们创建一个虚拟环境,这里python环境为2 ...

清华源.中科大源大部分时间能用,但没事也会被封.最近发现的北外源挺好用.推荐使用: 北外镜像(推荐): conda config --add channels https://mirrors.bfsu ...

最近几天,后台几个小伙伴问我,无论pip还是conda安装pytorch都太慢了,都是安装官方文档去做的,就是超时装不上,无法开展下一步,卡脖子的感觉太不好受. 这些小伙伴按照pytorch官档提示, ...

本来是想测试一下,使用pyscenic做转录因子分析,然后记录笔记给大家!所以就有了昨天的:使用pyscenic做转录因子分析,但实际上我在里面埋下了一个伏笔,就是使用conda安装的这个pyscen ...

单细胞进阶分析主要是拟时序分析,细胞通讯分析,以及SCENIC转录因子分析.但实际上随着越来越多单细胞研究从CNS正刊跌落到CNS子刊,再到普通的数据挖掘文章,所谓的进阶分析也要沦落为标准分析啦. 不 ...

去年我们在<生信技能树>公众号带领大家一起学习过:SCENIC转录因子分析结果的解读 ,提到了在做单细胞转录因子分析,首选的工具就是SCENIC流程,其工作流程两次发表在nature系列杂 ...

看到数据集 GSE103115,是关于:Cisplatin-induced gene expression changes in triple-negative breast cancer (TNBC ...

现在人意识到湿浊才是现代人最大的健康顽敌.这也是我反复强调阳气不足,湿邪不去,吃再多药品补品都如同隔山打牛的意义所在. 老百姓都知道治病要除根,那么怎么才能除病根呢?其实祛除痰湿就是在挖病根,哪怕是认 ...

现在很多孩子的运动能力特别强,身为成年人的我们,有时候都会自叹不如.一个来自山东烟台的小女孩,每天下午都会在大广场练习跳绳,行云流水般的花式跳绳,令无数路人驻足观看.小女孩充满自信地说,"我 ...

一吃就饱.嗳气放屁.腹部隐痛,一喝冷饮.吃块冰西瓜就腹痛.腹泻:一进考场就想上厕所:一着急.一生气就肚痛:一吃火锅.麻辣烫,马上就拉肚子...... 很多人做了胃镜.肠镜,一大堆检查,什么问题都没有发 ...

鸽子属于家庭范畴.它们也可以在以吃.药膳鸽子是一种非常好的滋补品,特别是对于骨骼不好的人.鸽子可以在体内补充维生素和蛋白质以,因为鸽子的肉质细嫩,纤维素少,不会给身体带来太多的杂质.药膳鸽子需要桂圆. ...

使用pyscenic做转录因子分析